RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525334.5

TSPAN4-215, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 3

Gene TSPAN4, Length 860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-215ENST00000525334 CEACAM6P40199 344 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 F2RL1P55085 397 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 FAM71F2Q6NXP2 309 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 SFXN4Q6P4A7 337 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 OR4X2Q8NGF9 303 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 OR8H1Q8NGG4 311 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 R3HDM4Q96D70 268 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 ZNF251Q9BRH9 671 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 ABCG5Q9H222 651 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 PIPOXQ9P0Z9 390 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 LINC01548A6NM66 108 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 ITGB1BP1O14713 200 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 RAB29O14966 203 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 CLEC2LP0C7M8 214 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 GPR12P47775 334 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 MXD1Q05195 221 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 RPL39P5Q59GN2 51 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 ZNF329Q86UD4 541 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 OR4F17Q8NGA8 305 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 EDARADDQ8WWZ3 215 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 ABHD14BQ96IU4 210 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 OR4F4Q96R69 305 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 RASL11BQ9BPW5 248 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 AGMATQ9BSE5 352 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 CENPOQ9BU64 300 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 LINC00527Q9UJ94 153 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 TNFAIP8O95379 198 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 MMDQ15546 238 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 FOXRED2Q8IWF2 684 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 TSPAN14Q8NG11 270 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 OR4A4PQ8NGN8 299 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 LGALS14Q8TCE9 139 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 CHPT1Q8WUD6 406 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 A0A087WXM4 84 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 FABP7O15540 132 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 ACTBP60709 375 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 ARFRP1Q13795 201 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 KIR2DS1Q14954 304 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 STPG2Q8N412 459 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 MAFIPQ8WZ33 124 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 RITA1Q96K30 269 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 HSPB9Q9BQS6 159 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 AP4M1O00189 453 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 CT45A6P0DMU7 189 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 CT45A5P0DMU8 189 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 CT45A7P0DMV0 189 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 CNTFRP26992 372 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 IGSF11Q5DX21 431 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 FAM131AQ6UXB0 335 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 C1QL4Q86Z23 238 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 CABLES2Q9BTV7 478 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 GHITMQ9H3K2 345 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 RDH8Q9NYR8 311 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 RNF150Q9ULK6 438 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN4-215ENST00000525334 BET1O15155 118 aa14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4-215ENST00000525334 GSTT2P0CG29 244 aa14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4-215ENST00000525334 GSTT2BP0CG30 244 aa14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4-215ENST00000525334 SOX6P35712 828 aa14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4-215ENST00000525334 TALDO1P37837 337 aa14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4-215ENST00000525334 SERPINB10P48595 397 aa14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4-215ENST00000525334 SLC35B1P78383 322 aa14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4-215ENST00000525334 ARL6IP1Q15041 203 aa14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4-215ENST00000525334 CDNFQ49AH0 187 aa14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4-215ENST00000525334 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4-215ENST00000525334 PHF21AQ96BD5 680 aa14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4-215ENST00000525334 TOLLIPQ9H0E2 274 aa14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4-215ENST00000525334 VCX3AQ9NNX9 186 aa14.58□□□□□ -0.08
TSPAN4-215ENST00000525334 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa14.57□□□□□ -0.08
TSPAN4-215ENST00000525334 OR5H14A6NHG9 310 aa14.57□□□□□ -0.08
TSPAN4-215ENST00000525334 NBR2O15453 112 aa14.57□□□□□ -0.08
TSPAN4-215ENST00000525334 PROP1O75360 226 aa14.57□□□□□ -0.08
TSPAN4-215ENST00000525334 PF4V1P10720 104 aa14.57□□□□□ -0.08
TSPAN4-215ENST00000525334 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa14.57□□□□□ -0.08
TSPAN4-215ENST00000525334 IDNKQ5T6J7 187 aa14.57□□□□□ -0.08
TSPAN4-215ENST00000525334 YIPF6Q96EC8 236 aa14.57□□□□□ -0.08
TSPAN4-215ENST00000525334 RHBDL2Q9NX52 303 aa14.57□□□□□ -0.08
TSPAN4-215ENST00000525334 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TSPAN4-215ENST00000525334 ZNF221Q9UK13 617 aa14.57□□□□□ -0.08
TSPAN4-215ENST00000525334 PLXNB1O43157 2135 aa14.56□□□□□ -0.08
TSPAN4-215ENST00000525334 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa14.56□□□□□ -0.08
TSPAN4-215ENST00000525334 G3V4G9 280 aa14.56□□□□□ -0.08
TSPAN4-215ENST00000525334 H0YJW9 148 aa14.56□□□□□ -0.08
TSPAN4-215ENST00000525334 SCGNO76038 276 aa14.56□□□□□ -0.08
TSPAN4-215ENST00000525334 DIRAS3O95661 229 aa14.56□□□□□ -0.08
TSPAN4-215ENST00000525334 DTYMKP23919 212 aa14.56□□□□□ -0.08
TSPAN4-215ENST00000525334 TGFBR1P36897 503 aa14.56□□□□□ -0.08
TSPAN4-215ENST00000525334 SCAND1P57086 179 aa14.56□□□□□ -0.08
TSPAN4-215ENST00000525334 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
TSPAN4-215ENST00000525334 HACD4Q5VWC8 232 aa14.56□□□□□ -0.08
TSPAN4-215ENST00000525334 Q6ZS49 121 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms