RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492539.5

NELFE-212, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 583 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-212ENST00000492539 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 IGHG4P01861 327 aa15.55■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 IGHV3-43DP0DP04 118 aa15.55■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 ZNF137PP52743 207 aa15.55■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 OR8H1Q8NGG4 311 aa15.55■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 UBALD1Q8TB05 177 aa15.55■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 C4orf3Q8WVX3 66 aa15.55■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 RASL11BQ9BPW5 248 aa15.55■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 NICN1Q9BSH3 213 aa15.55■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 FUNDC2Q9BWH2 189 aa15.55■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa15.54■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 SEC14L6B5MCN3 397 aa15.54■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 SLC31A2O15432 143 aa15.54■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 TXNL1O43396 289 aa15.54■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 IGF1P05019 195 aa15.54■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 CHATP28329 748 aa15.54■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 ZNF497Q6ZNH5 498 aa15.54■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 FAM89BQ8N5H3 189 aa15.54■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 ZNF439Q8NDP4 499 aa15.54■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 MYOZ3Q8TDC0 251 aa15.54■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 CCDC107Q8WV48 283 aa15.54■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 NEDD4LQ96PU5 975 aa15.54■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 ETAA1Q9NY74 926 aa15.54■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 A0A0A6YYD4 124 aa15.53■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 CA11O75493 328 aa15.53■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 MT-ND4P03905 459 aa15.53■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 VDAC1P21796 283 aa15.53■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 PSMB8P28062 276 aa15.53■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 ECI1P42126 302 aa15.53■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 F2RL1P55085 397 aa15.53■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 MXD1Q05195 221 aa15.53■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 SFXN4Q6P4A7 337 aa15.53■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 GAPTQ8N292 157 aa15.53■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 RAB22AQ9UL26 194 aa15.53■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 CLEC2LP0C7M8 214 aa15.52■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 RAB6AP20340 208 aa15.52■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 SOX6P35712 828 aa15.52■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 ALDH3B2P48448 385 aa15.52■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 PTX4Q96A99 478 aa15.52■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
NELFE-212ENST00000492539 SORL1Q92673 2214 aa15.52■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 A0A0B4J203 849 aa15.51■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 UBE2QL1A1L167 161 aa15.51■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 C12orf77C9JDV5 145 aa15.51■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 C3orf84H3BNL1 204 aa15.51■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 TFAP2AP05549 437 aa15.51■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 TGFBR1P36897 503 aa15.51■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 ZNF134P52741 427 aa15.51■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 LSM3P62310 102 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 PLA2G7Q13093 441 aa15.51■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 TMEM30BQ3MIR4 351 aa15.51■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 OR11H1Q8NG94 326 aa15.51■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 OR56B1Q8NGI3 324 aa15.51■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 SULT4A1Q9BR01 284 aa15.51■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 DAPK2Q9UIK4 370 aa15.51■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 SOCS1O15524 211 aa15.5■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 TMEM127O75204 238 aa15.5■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 OR5H8P0DN80 308 aa15.5■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 PPIFP30405 207 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 ZNF260Q3ZCT1 412 aa15.5■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 CT45A1Q5HYN5 189 aa15.5■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 C6orf201Q7Z4U5 140 aa15.5■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 CT45A3Q8NHU0 189 aa15.5■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 CYYR1Q96J86 154 aa15.5■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 ASCL2Q99929 193 aa15.5■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa15.5■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 HSF4Q9ULV5 492 aa15.5■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 VEGFCP49767 419 aa15.49■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 SCAND1P57086 179 aa15.49■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 LSAMPQ13449 338 aa15.49■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 ASPHD1Q5U4P2 390 aa15.49■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 GPR141Q7Z602 305 aa15.49■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa15.49■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 CROCCP3Q8IVE0 287 aa15.49■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 UBE2E2Q96LR5 201 aa15.49■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 FAAP24Q9BTP7 215 aa15.49■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 RAB9BQ9NP90 201 aa15.49■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa15.49■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 I3L521 148 aa15.48■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 SPINT2O43291 252 aa15.48■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 GABARAPO95166 117 aa15.48■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 INSL3P51460 131 aa15.48■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 TMEM50BP56557 158 aa15.48■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 NCS1P62166 190 aa15.48■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 RUNX1Q01196 453 aa15.48■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 C6orf183Q5T699 404 aa15.48■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 STEAP3Q658P3 488 aa15.48■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 TRAT1Q6PIZ9 186 aa15.48■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 OR10V1Q8NGI7 309 aa15.48■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 OR4K15Q8NH41 348 aa15.48■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 GNB4Q9HAV0 340 aa15.48■□□□□ 0.07
NELFE-212ENST00000492539 GNG12Q9UBI6 72 aa15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms