RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
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PRAME-211ENST00000476336 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
PRAME-211ENST00000476336 H7C2Y5 167 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-211ENST00000476336 NBR2O15453 112 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-211ENST00000476336 APOA2P02652 100 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-211ENST00000476336 CT45A6P0DMU7 189 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-211ENST00000476336 CT45A5P0DMU8 189 aa10.56□□□□□ -0.72
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