RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 LIN54Q6MZP7 749 aa16.33■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 MINDY2Q8NBR6 621 aa16.33■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 OR6M1Q8NGM8 313 aa16.33■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 KLK15Q9H2R5 256 aa16.33■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 GNB4Q9HAV0 340 aa16.33■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 PARP11Q9NR21 331 aa16.33■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 SLC23A1Q9UHI7 598 aa16.33■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 TENM3Q9P273 2699 aa16.32■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 OR5H14A6NHG9 310 aa16.32■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 G3V318 75 aa16.32■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF616Q08AN1 781 aa16.32■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa16.32■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 IL1F10Q8WWZ1 152 aa16.32■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 NICN1Q9BSH3 213 aa16.32■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 WSB1Q9Y6I7 421 aa16.32■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 RAB9AP51151 201 aa16.31■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 ASPHD1Q5U4P2 390 aa16.31■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 CEACAM19Q7Z692 300 aa16.31■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa16.31■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 MGAT4AQ9UM21 535 aa16.31■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 RYR3Q15413 4870 aa16.31■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 A0A0A6YYD4 124 aa16.3■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 ANKRD65E5RJM6 399 aa16.3■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 ST8SIA5O15466 376 aa16.3■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 MC5RP33032 325 aa16.3■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 ECI1P42126 302 aa16.3■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 IRF3Q14653 427 aa16.3■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 MED22Q15528 200 aa16.3■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF260Q3ZCT1 412 aa16.3■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 FAM131AQ6UXB0 335 aa16.3■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 FAM89BQ8N5H3 189 aa16.3■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 OR1N2Q8NGR9 330 aa16.3■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 UFD1Q92890 307 aa16.3■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 PRR25Q96S07 402 aa16.3■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 AGMATQ9BSE5 352 aa16.3■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 LPAR5Q9H1C0 372 aa16.3■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 KCNK15Q9H427 330 aa16.3■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 SCN3BQ9NY72 215 aa16.3■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 HSF4Q9ULV5 492 aa16.3■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 PTGES3LE9PB15 166 aa16.29■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 RRHO14718 337 aa16.29■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 RBBP9O75884 186 aa16.29■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 CT45A6P0DMU7 189 aa16.29■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 CT45A5P0DMU8 189 aa16.29■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 CT45A7P0DMV0 189 aa16.29■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 GNB1P62873 340 aa16.29■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 NDPQ00604 133 aa16.29■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 OR5AN1Q8NGI8 311 aa16.29■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 EDARADDQ8WWZ3 215 aa16.29■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 RNF5Q99942 180 aa16.29■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa16.29■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 H0YJW9 148 aa16.28■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 SLC17A2O00624 439 aa16.28■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 HLA-DRB3P79483 266 aa16.28■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 TRAM1Q15629 374 aa16.28■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 RPL39P5Q59GN2 51 aa16.28■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 ISYNA1Q9NPH2 558 aa16.28■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 WASHC3Q9Y3C0 194 aa16.28■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 FBXO7Q9Y3I1 522 aa16.28■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 SOX15O60248 233 aa16.27■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 ARSBP15848 533 aa16.27■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 ZBTB25P24278 435 aa16.27■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 CX3CL1P78423 397 aa16.27■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 TPBGQ13641 420 aa16.27■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 LIPKQ5VXJ0 399 aa16.27■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 PYHIN1Q6K0P9 492 aa16.27■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa16.27■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF429Q86V71 674 aa16.27■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 SETD6Q8TBK2 473 aa16.27■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 PTX4Q96A99 478 aa16.27■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 C12orf4Q9NQ89 552 aa16.27■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 AK3Q9UIJ7 227 aa16.27■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 U3KQK5 164 aa16.27■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 SOCS1O15524 211 aa16.26■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 ARL6IP5O75915 188 aa16.26■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 RANBP1P43487 201 aa16.26■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 ECSCRQ19T08 205 aa16.26■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM91Q6ZNR0 172 aa16.26■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 ABHD14BQ96IU4 210 aa16.26■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 GFI1Q99684 422 aa16.26■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 FBXL15Q9H469 300 aa16.26■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 DUSP21Q9H596 190 aa16.26■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 PLGRKTQ9HBL7 147 aa16.26■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 RNF150Q9ULK6 438 aa16.26■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa16.26■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PN81 502 aa16.25■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 OVOL1O14753 267 aa16.25■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 SPDEFO95238 335 aa16.25■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 CHRNA7P36544 502 aa16.25■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 PLGLAQ15195 96 aa16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms