RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 BTNL8Q6UX41 500 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 P4HA3Q7Z4N8 544 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 TUSC5Q8IXB3 177 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 OR4A4PQ8NGN8 299 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 FGFBP3Q8TAT2 258 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 STARD4Q96DR4 205 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM56Q96MV1 263 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 GINS3Q9BRX5 216 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 RTL8AQ9BWD3 113 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM222Q9H0R3 208 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 ARV1Q9H2C2 271 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 IFT22Q9H7X7 185 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 MLXQ9UH92 298 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 PRELID1Q9Y255 219 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP23Q9Y6H3 246 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 CADP27708 2225 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 J3QT63 122 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 DFFBO76075 338 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 NAPSAO96009 420 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 WNT2P09544 360 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 BCL3P20749 454 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 TUBG1P23258 451 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 GNRHRP30968 328 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 NTF4P34130 210 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNJ3P48549 501 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 DEFA6Q01524 100 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 IL24Q13007 206 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 OR8G1Q15617 311 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 SMUG1Q53HV7 270 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM120AOSQ5T036 256 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 OR2A2Q6IF42 318 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 Q6ZRG5 221 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 LYZL2Q7Z4W2 148 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM58AQ8N1B3 248 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 OR8G5Q8NG78 346 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 OR5D13Q8NGL4 314 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 OR10J5Q8NHC4 309 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 GLYATL2Q8WU03 294 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 SECTM1Q8WVN6 248 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 NEUROG1Q92886 237 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 SLAMF9Q96A28 289 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 POM121L2Q96KW2 1035 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 NRIP2Q9BQI9 281 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 CDH20Q9HBT6 801 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 TUBG2Q9NRH3 451 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 SMCO4Q9NRQ5 59 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM160Q9NX00 188 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 PRR13Q9NZ81 148 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 TREM2Q9NZC2 230 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 AMDHD2Q9Y303 409 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A096LPE4 126 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1B0GW64 132 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1W2PPZ6 126 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC22A20A6NK97 555 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM210A6NLX4 147 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 H0Y980 276 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 PITX3O75364 302 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 TUSC2O75896 110 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 IGHV3-9P01782 118 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 HLA-HP01893 362 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 HBE1P02100 147 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 CD5P06127 495 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 SERPINE2P07093 398 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 SFTA3P0C7M3 94 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 DANCRP0C864 163 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 IGHV4-31P0DP07 118 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 VDAC1P21796 283 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 UCP1P25874 307 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 LPAR6P43657 344 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 NPBWR2P48146 333 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 HLA-DRB3P79483 266 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 MZT1Q08AG7 82 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 GABRA6Q16445 453 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 MST1LQ2TV78 715 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 SP6Q3SY56 376 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 FBXW9Q5XUX1 488 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 DPPA3Q6W0C5 159 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 TBC1D26Q86UD7 250 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 STX12Q86Y82 276 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 LDLRAD3Q86YD5 345 aa5.91□□□□□ -1.46
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