RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 CENPOQ9BU64 300 aa9.47□□□□□ -0.89
CTIF-208ENST00000590422 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CTIF-208ENST00000590422 CEPT1Q9Y6K0 416 aa9.47□□□□□ -0.89
CTIF-208ENST00000590422 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CTIF-208ENST00000590422 SORL1Q92673 2214 aa9.46□□□□□ -0.89
CTIF-208ENST00000590422 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa9.46□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 DPPA5A6NC42 116 aa9.46□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 C12orf77C9JDV5 145 aa9.46□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 ARL6IP5O75915 188 aa9.46□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 MOSP00540 346 aa9.46□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 MT-ND4P03905 459 aa9.46□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 CSTBP04080 98 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 CALRP27797 417 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 BDKRB2P30411 391 aa9.46□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 ZNF134P52741 427 aa9.46□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 ZNF137PP52743 207 aa9.46□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 TMBIM6P55061 237 aa9.46□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 PPP3R1P63098 170 aa9.46□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 FHL3Q13643 280 aa9.46□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 CTF1Q16619 201 aa9.46□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 MPV17LQ2QL34 196 aa9.46□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 LINC00596Q86U02 117 aa9.46□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 OR10V1Q8NGI7 309 aa9.46□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 NEK7Q8TDX7 302 aa9.46□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 RNF167Q9H6Y7 350 aa9.46□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 CKLFQ9UBR5 152 aa9.46□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa9.45□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa9.45□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 SHISA3A0PJX4 238 aa9.45□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 ORC5O43913 435 aa9.45□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 IGHG4P01861 327 aa9.45□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 SRMP19623 302 aa9.45□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 CD1BP29016 333 aa9.45□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 NCS1P62166 190 aa9.45□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 LSM3P62310 102 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 KIR2DS1Q14954 304 aa9.45□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 CT45A1Q5HYN5 189 aa9.45□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 ASPHD1Q5U4P2 390 aa9.45□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 LRRTM1Q86UE6 522 aa9.45□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 GAPTQ8N292 157 aa9.45□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 PRR18Q8N4B5 295 aa9.45□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 OR5M8Q8NGP6 311 aa9.45□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 OR4K15Q8NH41 348 aa9.45□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 OR1L1Q8NH94 360 aa9.45□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 CT45A3Q8NHU0 189 aa9.45□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 RAB2BQ8WUD1 216 aa9.45□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 C4orf3Q8WVX3 66 aa9.45□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 KCTD7Q96MP8 289 aa9.45□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 BCL7BQ9BQE9 202 aa9.45□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 NDUFA13Q9P0J0 144 aa9.45□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 U3KQK5 164 aa9.45□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 RYR2Q92736 4967 aa9.45□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 A6NHS1 94 aa9.44□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 SEC14L6B5MCN3 397 aa9.44□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 RAMP3O60896 148 aa9.44□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 HBZP02008 142 aa9.44□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 ELANEP08246 267 aa9.44□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 GTF2F2P13984 249 aa9.44□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 IL3RAP26951 378 aa9.44□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 PSMB8P28062 276 aa9.44□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 SOX6P35712 828 aa9.44□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 TGFBR1P36897 503 aa9.44□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 ECI1P42126 302 aa9.44□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 VBP1P61758 197 aa9.44□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 LSAMPQ13449 338 aa9.44□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 GNMTQ14749 295 aa9.44□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 C9orf66Q5T8R8 295 aa9.44□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 C5orf24Q7Z6I8 188 aa9.44□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 MYOZ3Q8TDC0 251 aa9.44□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 ISOC1Q96CN7 298 aa9.44□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 ASCL2Q99929 193 aa9.44□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 RASL11BQ9BPW5 248 aa9.44□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 GON7Q9BXV9 100 aa9.44□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 GNG12Q9UBI6 72 aa9.44□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 G3V318 75 aa9.43□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 MAS1P04201 325 aa9.43□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 IGF1P05019 195 aa9.43□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 CD37P11049 281 aa9.43□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 VDAC1P21796 283 aa9.43□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 MYL9P24844 172 aa9.43□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 SDC2P34741 201 aa9.43□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 Q3ZCU0 254 aa9.43□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 RAB12Q6IQ22 244 aa9.43□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 OR8H1Q8NGG4 311 aa9.43□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 S100A13Q99584 98 aa9.43□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 KLK15Q9H2R5 256 aa9.43□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 BANF2Q9H503 90 aa9.43□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 GNB4Q9HAV0 340 aa9.43□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 BATF3Q9NR55 127 aa9.43□□□□□ -0.9
CTIF-208ENST00000590422 ETAA1Q9NY74 926 aa9.43□□□□□ -0.9
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