RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477563.6

RBBP4-211, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 5

Gene RBBP4, Length 544 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4-211ENST00000477563 IL3RAP26951 378 aa6.02□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 HTD2P86397 168 aa6.02□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 KCTD21Q4G0X4 260 aa6.02□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 ATAD3CQ5T2N8 411 aa6.02□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa6.02□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 FAM27D1Q5T7N8 215 aa6.02□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 FAM89BQ8N5H3 189 aa6.02□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 COMMD1Q8N668 190 aa6.02□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 TMEM104Q8NE00 496 aa6.02□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 MRGPRDQ8TDS7 321 aa6.02□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 CHPT1Q8WUD6 406 aa6.02□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 CAPSLQ8WWF8 208 aa6.02□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 PTX4Q96A99 478 aa6.02□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 SELENOIQ9C0D9 397 aa6.02□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 GFOD1Q9NXC2 390 aa6.02□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 ETAA1Q9NY74 926 aa6.02□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 JPT1Q9UK76 154 aa6.02□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 HSPB6O14558 160 aa6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 ITGB1BP1O14713 200 aa6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 FGF16O43320 207 aa6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 NAPSAO96009 420 aa6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 IGHG2P01859 326 aa6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 FAM106CPP0CH98 169 aa6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 HSMCR30P0CW71 290 aa6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 ARSBP15848 533 aa6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 MYL9P24844 172 aa6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 CD24P25063 80 aa6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 CALRP27797 417 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 SSTR5P35346 364 aa6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 GDNFP39905 211 aa6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 SCAND1P57086 179 aa6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 RPS25P62851 125 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 FABP5Q01469 135 aa6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 UNC119Q13432 240 aa6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 EBI3Q14213 229 aa6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 ARL6IP1Q15041 203 aa6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 SSX1Q16384 188 aa6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 C9orf66Q5T8R8 295 aa6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 SIGIRRQ6IA17 410 aa6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 FAM71F2Q6NXP2 309 aa6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF773Q6PK81 442 aa6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 C18orf65Q6ZTR6 163 aa6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 IZUMO1Q8IYV9 350 aa6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 RNF152Q8N8N0 203 aa6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 OR8H1Q8NGG4 311 aa6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 NEK7Q8TDX7 302 aa6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 TOMM40LQ969M1 308 aa6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 RPEQ96AT9 228 aa6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 RAX2Q96IS3 184 aa6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 NEDD4LQ96PU5 975 aa6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 CENPOQ9BU64 300 aa6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 GHITMQ9H3K2 345 aa6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 SCOCQ9UIL1 159 aa6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 PSG11Q9UQ72 335 aa6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 MOB4Q9Y3A3 225 aa6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 PEX16Q9Y5Y5 336 aa6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 V9GY05 133 aa6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.01□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 A0A1W2PPI3 338 aa6□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 C12orf77C9JDV5 145 aa6□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 CCL24O00175 119 aa6□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 LDLRAD4O15165 306 aa6□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 SCGNO76038 276 aa6□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 RGS11O94810 467 aa6□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 INSL4Q14641 139 aa6□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 KIR2DS1Q14954 304 aa6□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 P2RY14Q15391 338 aa6□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 HMGN3Q15651 99 aa6□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 RAB11BQ15907 218 aa6□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF880Q6PDB4 577 aa6□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF329Q86UD4 541 aa6□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 TPRA1Q86W33 373 aa6□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF695Q8IW36 515 aa6□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 SPARTQ8N0X7 666 aa6□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 C5orf56Q8N8D9 126 aa6□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF439Q8NDP4 499 aa6□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa6□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 OR56B1Q8NGI3 324 aa6□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 OR10X1Q8NGY0 326 aa6□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 ARL11Q969Q4 196 aa6□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa6□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 GFI1Q99684 422 aa6□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 ASCL2Q99929 193 aa6□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 RSRP1Q9BUV0 290 aa6□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 LPAR5Q9H1C0 372 aa6□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 BANF2Q9H503 90 aa6□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 PLGRKTQ9HBL7 147 aa6□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 KCNIP1Q9NZI2 227 aa6□□□□□ -1.45
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF581Q9P0T4 197 aa6□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms