RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 GLRA1P23415 457 aa6.63□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 RAB7AP51149 207 aa6.63□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 PLGLAQ15195 96 aa6.63□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 CLEC2AQ6UVW9 174 aa6.63□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 DMBX1Q8NFW5 382 aa6.63□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 OR4S1Q8NGB4 309 aa6.63□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa6.63□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa6.63□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa6.63□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.63□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 A0A1W2PR80 420 aa6.63□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 DHRS7CA6NNS2 312 aa6.63□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 FCN1O00602 326 aa6.63□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 DEGS1O15121 323 aa6.63□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 WISP1O95388 367 aa6.63□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 Q6ZT83 130 aa6.63□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 OR10J5Q8NHC4 309 aa6.63□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 ABHD3Q8WU67 409 aa6.63□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 TBX15Q96SF7 602 aa6.63□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 TUBA4BQ9H853 241 aa6.63□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 CLCF1Q9UBD9 225 aa6.63□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 NAGKQ9UJ70 344 aa6.63□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 YIF1AO95070 293 aa6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 CCL1P22362 96 aa6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 ERVS71-1P61550 626 aa6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 OR5D13Q8NGL4 314 aa6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 SLC25A38Q96DW6 304 aa6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 ELOVL1Q9BW60 279 aa6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 LINC00587B1AMM8 73 aa6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 MT-ND6P03923 174 aa6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 CDAP32320 146 aa6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 GABRA6Q16445 453 aa6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 SPANXN5Q5MJ07 72 aa6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 OR10AC1Q8NH08 325 aa6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 OR51E1Q8TCB6 317 aa6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 GFI1Q99684 422 aa6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 GPR84Q9NQS5 396 aa6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 GNG12Q9UBI6 72 aa6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 CT45A10P0DMU9 189 aa6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 FHITP49789 147 aa6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 TCTAP57738 103 aa6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 ERVFC1-1P60608 527 aa6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 MICBQ29980 383 aa6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 HLA-DRB5Q30154 266 aa6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 UCN2Q96RP3 112 aa6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 SRXN1Q9BYN0 137 aa6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 OR2A4O95047 310 aa6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 C1QTNF9P0C862 333 aa6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 NDUFB7P17568 137 aa6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 CNN1P51911 297 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 GUCA2AQ02747 115 aa6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 FA2HQ7L5A8 372 aa6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 GGNQ86UU5 652 aa6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 OR1P1Q8NH06 330 aa6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 HIST1H2BAQ96A08 127 aa6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 OR2A7Q96R45 310 aa6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 MTCH1Q9NZJ7 389 aa6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 DOK5Q9P104 306 aa6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 TAAR3PQ9P1P4 343 aa6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 FBLN5Q9UBX5 448 aa6.62□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 RER1O15258 196 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 DHRS3O75911 302 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 NEURL1O76050 574 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 FCER1GP30273 86 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 SRP14P37108 136 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 GFRA1P56159 465 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 OR8B12Q8NGG6 310 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 PIGTQ969N2 578 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 ADGRG7Q96K78 797 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 BANF2Q9H503 90 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 TRAV34A0A0B4J273 112 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 NDUFA2O43678 99 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 ZNF737O75373 536 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 OR10J4P0C629 311 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 RTL8BQ17RB0 113 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 RPEL1Q2QD12 228 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 TSPO2Q5TGU0 170 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 PRR18Q8N4B5 295 aa6.61□□□□□ -1.35
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