RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

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Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 NOTOA8MTQ0 251 aa6.77□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 SERPINE3A8MV23 424 aa6.77□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 SOCS1O15524 211 aa6.77□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 HSPA12AO43301 675 aa6.77□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 KCNAB3O43448 404 aa6.77□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 AMY1AP04745 511 aa6.77□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 AMY2AP04746 511 aa6.77□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 CD3GP09693 182 aa6.77□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 ZBTB25P24278 435 aa6.77□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 SERPINB10P48595 397 aa6.77□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF134P52741 427 aa6.77□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM50BP56557 158 aa6.77□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 SCAND1P57086 179 aa6.77□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 CD83Q01151 205 aa6.77□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa6.77□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 KIR2DS1Q14954 304 aa6.77□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa6.77□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 C9orf152Q5JTZ5 239 aa6.77□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 HES5Q5TA89 166 aa6.77□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 C22orf42Q6IC83 251 aa6.77□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 FOXRED2Q8IWF2 684 aa6.77□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 LYG1Q8N1E2 194 aa6.77□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 COMMD1Q8N668 190 aa6.77□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 Q8N6K4 173 aa6.77□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 OR4X2Q8NGF9 303 aa6.77□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 OR10V1Q8NGI7 309 aa6.77□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 OR10R2Q8NGX6 335 aa6.77□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 UBALD1Q8TB05 177 aa6.77□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 IL1F10Q8WWZ1 152 aa6.77□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa6.77□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 KCTD7Q96MP8 289 aa6.77□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 S1PR3Q99500 378 aa6.77□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa6.77□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 PECRQ9BY49 303 aa6.77□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.77□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 AK3Q9UIJ7 227 aa6.77□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A087WXM4 84 aa6.76□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 TRDCB7Z8K6 153 aa6.76□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 RAB29O14966 203 aa6.76□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 IGHG2P01859 326 aa6.76□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC6A1P30531 599 aa6.76□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 MC5RP33032 325 aa6.76□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 REG1BP48304 166 aa6.76□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 CLDN12P56749 244 aa6.76□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC35B1P78383 322 aa6.76□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 HNF4GQ14541 408 aa6.76□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.76□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 Q6ZS46 218 aa6.76□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 CROCCP3Q8IVE0 287 aa6.76□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 C5orf56Q8N8D9 126 aa6.76□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 OR52L2PQ8NGH6 319 aa6.76□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 OR4A4PQ8NGN8 299 aa6.76□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 SETD6Q8TBK2 473 aa6.76□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 PHF21AQ96BD5 680 aa6.76□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 RASL11BQ9BPW5 248 aa6.76□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 Q9N2K0 584 aa6.76□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF580Q9UK33 172 aa6.76□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa6.75□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 PSMB11A5LHX3 300 aa6.75□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 AP4M1O00189 453 aa6.75□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 RAB27BO00194 218 aa6.75□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC31A2O15432 143 aa6.75□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 PLXNB1O43157 2135 aa6.75□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 RRP9O43818 475 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 RBBP9O75884 186 aa6.75□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 TNFAIP8O95379 198 aa6.75□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 CD28P10747 220 aa6.75□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 TALDO1P37837 337 aa6.75□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 CEACAM6P40199 344 aa6.75□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 HLA-DRB3P79483 266 aa6.75□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 PITPNAQ00169 270 aa6.75□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 LSAMPQ13449 338 aa6.75□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 PLAC9Q5JTB6 97 aa6.75□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 Q6ZS49 121 aa6.75□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa6.75□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC35E3Q7Z769 313 aa6.75□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 C11orf44Q8N8P7 122 aa6.75□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 RNF5Q99942 180 aa6.75□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 TOLLIPQ9H0E2 274 aa6.75□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 ABCG5Q9H222 651 aa6.75□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 KCNK15Q9H427 330 aa6.75□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 ZFP57Q9NU63 452 aa6.75□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF221Q9UK13 617 aa6.75□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A0A6YYH2 397 aa6.74□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa6.74□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 SHISA3A0PJX4 238 aa6.74□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 OR5H14A6NHG9 310 aa6.74□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 A6NJ64 397 aa6.74□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 TSPAN15O95858 294 aa6.74□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
MT-TS1-201ENST00000387416 CTXN2P0C2S0 81 aa6.74□□□□□ -1.33
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