RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365426.1

RNU6-1335P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1335, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1335P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C1QTNF8P60827 252 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ACTG1P63261 375 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 IFITM2Q01629 132 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CD164Q04900 197 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DMTNQ08495 405 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 HTR4Q13639 388 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 APOFQ13790 326 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FAM53BQ14153 422 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OR8G1Q15617 311 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CCL15Q16663 113 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TBC1D28Q2M2D7 210 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 NDUFAF6Q330K2 333 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C6orf183Q5T699 404 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SDHAF4Q5VUM1 108 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GLYATQ6IB77 296 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TMEM220Q6QAJ8 160 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 LYZL1Q6UWQ5 148 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C5orf46Q6UWT4 87 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DPPA3Q6W0C5 159 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 AHSA2Q719I0 299 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SCXQ7RTU7 201 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 AAED1Q7RTV5 226 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FAM9CQ8IZT9 166 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZFP82Q8N141 532 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C17orf78Q8N4C9 275 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OTUD6BQ8N6M0 293 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C12orf29Q8N999 325 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OR11H1Q8NG94 326 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OR5AR1Q8NGP9 310 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PATE1Q8WXA2 126 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OPTNQ96CV9 577 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C19orf60Q96EN9 201 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SLC35G5Q96KT7 338 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CFAP53Q96M91 514 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RBP7Q96R05 134 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 LINC01587Q99440 93 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TBX5Q99593 518 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GPR22Q99680 433 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DRC3Q9H069 523 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RAB1BQ9H0U4 201 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GTSF1LQ9H1H1 148 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OR2D2Q9H210 308 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 VCX3BQ9H321 246 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 USE1Q9NZ43 259 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 AK3Q9UIJ7 227 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZNF229Q9UJW7 825 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 HEY1Q9Y5J3 304 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 U3KQK5 164 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PCNX2A6NKB5 2137 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DENND4AQ7Z401 1863 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DYSFO75923 2080 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ANKRD12Q6UB98 2062 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 NACADO15069 1562 aa0.4□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TTC41PQ6P2S7 1318 aa0.4□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa0.4□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa0.4□□□□□ -2.34
RNU6-1335P-201ENST00000365426 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 A0A0J9YW62 118 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 A0A1B0GW15 77 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 A0A1W2PNM2 257 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TVP23AA6NH52 213 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 HMSDA8MTL9 139 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C17orf98A8MV24 154 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DISC1C4P0D8 188 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C9J4A7 227 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TMEM250H0YL14 139 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CCRL2O00421 344 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ITGB1BP1O14713 200 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ACOX3O15254 700 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 AKR7A2O43488 359 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GNRH2O43555 120 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KDELR3O43731 214 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ATP6V1G2O95670 118 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 LTAP01374 205 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CRPP02741 224 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TRGV3P03979 118 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 HLA-DQB2P05538 268 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SERPINA7P05543 415 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FAM228BP0C875 321 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ESDP10768 282 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GABRA1P14867 456 aa0.4□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms