RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542777.1

DDX11-222, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 2

Gene DDX11, Length 489 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-222	ENST00000542777	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		12.57	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	GHSR	Q92847	366 aa		12.57	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		12.57	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	RAB9B	Q9NP90	201 aa		12.57	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	ETAA1	Q9NY74	926 aa		12.57	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		12.56	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		12.56	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	LALBA	P00709	142 aa		12.56	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	IGHG4	P01861	327 aa		12.56	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF137P	P52743	207 aa		12.56	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	CFHR3	Q02985	330 aa		12.56	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	ST3GAL4	Q11206	333 aa		12.56	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		12.56	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	C6orf183	Q5T699	404 aa		12.56	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		12.56	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	PRR18	Q8N4B5	295 aa		12.56	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		12.56	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	OR1L1	Q8NH94	360 aa		12.56	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	MUL1	Q969V5	352 aa		12.56	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	PRR25	Q96S07	402 aa		12.56	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	12.56	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	CKLF	Q9UBR5	152 aa		12.56	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	12.56	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	12.56	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	12.56	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	12.56	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		12.55	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	IRGM	A1A4Y4	181 aa		12.55	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		12.55	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	12.55	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	HBZ	P02008	142 aa		12.55	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	MYL12A	P19105	171 aa		12.55	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	ECI1	P42126	302 aa		12.55	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777		Q499Y3	187 aa		12.55	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	12.55	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	RAB12	Q6IQ22	244 aa		12.55	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		12.55	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		12.55	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	12.55	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	KCTD7	Q96MP8	289 aa		12.55	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		12.55	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	PTGES3L	E9PB15	166 aa		12.54	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	IGF1	P05019	195 aa		12.54	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	12.54	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	PSMB8	P28062	276 aa		12.54	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	12.54	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		12.54	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	STEAP3	Q658P3	488 aa		12.54	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		12.54	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	GAPT	Q8N292	157 aa		12.54	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		12.54	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		12.54	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM80	Q96HE8	168 aa		12.54	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	BANF2	Q9H503	90 aa		12.54	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	12.54	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	12.54	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	12.54	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	SCOC	Q9UIL1	159 aa		12.54	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777		U3KQK5	164 aa		12.54	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777		A0A1W2PPK0	400 aa		12.53	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		12.53	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	LANCL1	O43813	399 aa		12.53	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	OR5H8	P0DN80	308 aa		12.53	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	12.53	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	FST	P19883	344 aa		12.53	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	CRHBP	P24387	322 aa		12.53	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	LSAMP	Q13449	338 aa		12.53	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	MED21	Q13503	144 aa		12.53	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	MMD	Q15546	238 aa		12.53	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	MORN2	Q502X0	79 aa		12.53	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	AWAT2	Q6E213	333 aa		12.53	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	OR11H1	Q8NG94	326 aa		12.53	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		12.53	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		12.53	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		12.53	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	DUSP21	Q9H596	190 aa		12.53	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		12.53	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		12.53	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF580	Q9UK33	172 aa		12.53	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	TENM3	Q9P273	2699 aa		12.53	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		12.52	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	UBE2QL1	A1L167	161 aa		12.52	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		12.52	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		12.52	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		12.52	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	CA11	O75493	328 aa		12.52	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	SC5D	O75845	299 aa		12.52	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	MAS1	P04201	325 aa		12.52	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	CDK1	P06493	297 aa		12.52	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	MGMT	P16455	207 aa		12.52	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	FUT3	P21217	361 aa		12.52	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	FHL3	Q13643	280 aa		12.52	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		12.52	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	CDH26	Q8IXH8	852 aa		12.52	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	OR14A2	Q96R54	314 aa		12.52	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		12.52	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	RYR3	Q15413	4870 aa		12.52	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	GLA	P06280	429 aa		12.51	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	IRF3	Q14653	427 aa		12.51	□□□□□ -0.41

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