RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512131.5

SH3BP2-223, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-223	ENST00000512131	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SH3BP2-223	ENST00000512131	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SH3BP2-223	ENST00000512131	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	MFNG	O00587	321 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	CRYBA1	P05813	215 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	TGFBR1	P36897	503 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	HTD2	P86397	168 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	PLA1A	Q53H76	456 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131		A6NDX4	124 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	TSPAN9	O75954	239 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	TFAP2A	P05549	437 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	ALDH3B2	P48448	385 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	GNG10	P50151	68 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF134	P52741	427 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	MADCAM1	Q13477	382 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	LY6E	Q16553	131 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	GALM	Q96C23	342 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131		Q9N2K0	584 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	GNG12	Q9UBI6	72 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	JPT1	Q9UK76	154 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	ETV7	Q9Y603	341 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131		A0A1B0GUS0	222 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131		A0A1W2PPE3	182 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	SERPINE3	A8MV23	424 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	CHST1	O43916	411 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF137P	P52743	207 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	RAG2	P55895	527 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	MORN2	Q502X0	79 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131		Q6ZSV7	163 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	PRR18	Q8N4B5	295 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR4F5	Q8NH21	305 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	C16orf95	Q9H693	158 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	RAB18	Q9NP72	206 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131		A0A1W2PPI3	338 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	SLC31A2	O15432	143 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	YPEL1	O60688	119 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	SCGN	O76038	276 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	GNB3	P16520	340 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	BRS3	P32247	399 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	NCS1	P62166	190 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	ARL6IP1	Q15041	203 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	IDNK	Q5T6J7	187 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	RPE	Q96AT9	228 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	YPEL2	Q96QA6	119 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	GABARAP	O95166	117 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	MNDA	P41218	407 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	RAB7A	P51149	207 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	ARHGDIB	P52566	201 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	GNMT	Q14749	295 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	CTF1	Q16619	201 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR8H3	Q8N146	312 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	LINC01006	Q8NI28	216 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	CFHR4	Q92496	578 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	TOMM40L	Q969M1	308 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		13.85	□□□□□ -0.19

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