RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 NKAPLQ5M9Q1 402 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF773Q6PK81 442 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 C10orf99Q6UWK7 81 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 ODF3L1Q8IXM7 274 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 LYG1Q8N1E2 194 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 Q8N2B8 174 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 PRR18Q8N4B5 295 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC00311Q8N616 119 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 DRAM1Q8N682 238 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 C11orf44Q8N8P7 122 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 OR10A7Q8NGE5 316 aa5.59□□□□□ -1.51
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RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM59Q9BXS4 323 aa5.59□□□□□ -1.51
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RABGEF1-206ENST00000461017 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
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RABGEF1-206ENST00000461017 V9GY05 133 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1B0GUS0 222 aa5.58□□□□□ -1.52
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RABGEF1-206ENST00000461017 TIMM23O14925 209 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 ARL6IP5O75915 188 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 TSPAN15O95858 294 aa5.58□□□□□ -1.52
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RABGEF1-206ENST00000461017 GLAP06280 429 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP5.58□□□□□ -1.52
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RABGEF1-206ENST00000461017 UBBP0CG47 229 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 ARSBP15848 533 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 GADD45AP24522 165 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 HMGN3Q15651 99 aa5.58□□□□□ -1.52
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RABGEF1-206ENST00000461017 TM4SF20Q53R12 229 aa5.58□□□□□ -1.52
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RABGEF1-206ENST00000461017 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 OR2W3Q7Z3T1 314 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 KLHDC1Q8N7A1 406 aa5.58□□□□□ -1.52
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RABGEF1-206ENST00000461017 SGMS2Q8NHU3 365 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNG3Q8TAE7 436 aa5.58□□□□□ -1.52
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RABGEF1-206ENST00000461017 PLGRKTQ9HBL7 147 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 STEAP1Q9UHE8 339 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa5.57□□□□□ -1.52
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RABGEF1-206ENST00000461017 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa5.57□□□□□ -1.52
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RABGEF1-206ENST00000461017 PROP1O75360 226 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 LPLP06858 475 aa5.57□□□□□ -1.52
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RABGEF1-206ENST00000461017 VSIG10L2P0DP72 767 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 CD28P10747 220 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB3BP20337 219 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 GALP22466 123 aa5.57□□□□□ -1.52
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RABGEF1-206ENST00000461017 SDC2P34741 201 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC00205P59089 165 aa5.57□□□□□ -1.52
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RABGEF1-206ENST00000461017 ABCA11PQ4W5N1 156 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 Q6ZTK2 550 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 EDARADDQ8WWZ3 215 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 TOMM40LQ969M1 308 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 RPEQ96AT9 228 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 RITA1Q96K30 269 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 NEDD4LQ96PU5 975 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 Q9H521 79 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 SPACA1Q9HBV2 294 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 PLSCR3Q9NRY6 295 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 OR1A1Q9P1Q5 309 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB22AQ9UL26 194 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 STUB1Q9UNE7 303 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 TNCP24821 2201 aa5.56□□□□□ -1.52
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