RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 SLC25A46Q96AG3 418 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 GRAMD2BQ96HH9 432 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 RTL8AQ9BWD3 113 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 WDR13Q9H1Z4 485 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 OR51I2Q9H344 312 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 BANF2Q9H503 90 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 BATF3Q9NR55 127 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 FAIMQ9NVQ4 179 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 MTCH1Q9NZJ7 389 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 NDUFA13Q9P0J0 144 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF581Q9P0T4 197 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 COMMD3Q9UBI1 195 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 V9GY05 133 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 FASNP49327 2511 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 TACC2O95359 2948 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 FBN2P35556 2912 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 LRP5LA4QPB2 252 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 TRIM64BA6NI03 449 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 OR5B21A6NL26 309 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 IFITM5A6NNB3 132 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 SLC17A2O00624 439 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 SSX4O60224 188 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 HPGDSO60760 199 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 ALDOBP05062 364 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 SFTPBP07988 381 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 CFC1BP0CG36 223 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 CFC1P0CG37 223 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 CD80P33681 288 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 CD200P41217 278 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 PTGFRP43088 359 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 SRP9P49458 86 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 EVX1P49640 407 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 RORCP51449 518 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 BMXP51813 675 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 SCN1BQ07699 218 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 PDZK1IP1Q13113 114 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF273Q14593 569 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 RSU1Q15404 277 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 C1orf100Q5SVJ3 147 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 AVPI1Q5T686 147 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 FAM166AQ6J272 317 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 WDR82Q6UXN9 313 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 BIVMQ86UB2 503 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 NFE4Q86UQ8 179 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 TPRA1Q86W33 373 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF573Q86YE8 665 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM104Q8NE00 496 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 SLC24A4Q8NFF2 622 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 OR2AK2Q8NG84 335 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 OR6M1Q8NGM8 313 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 MCFD2Q8NI22 146 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 LGALS14Q8TCE9 139 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 LRRC29Q8WV35 223 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 AQP3Q92482 292 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 THRSPQ92748 146 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 SPSB1Q96BD6 273 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 FAM3DQ96BQ1 224 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 C10orf35Q96D05 121 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 C14orf79Q96F83 325 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 S100A13Q99584 98 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 CCL19Q99731 98 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 NICN1Q9BSH3 213 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 SELENOIQ9C0D9 397 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 SLC22A4Q9H015 551 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 RAB1BQ9H0U4 201 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 NARFLQ9H6Q4 476 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 OR5V1Q9UGF6 321 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 IL19Q9UHD0 177 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 CENPEQ02224 2701 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 A0A075B6Q4 140 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1B0GWJ7 208 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM210A6NLX4 147 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 TRAPPC2LH3BP13 241 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 J3QT63 122 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 AIPO00170 330 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 RGS5O15539 181 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 SPINT2O43291 252 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 NXPH2O95156 264 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 CYB5AP00167 134 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 IGHV4-39P01824 125 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 PRSS1P07477 247 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 CD55P08174 381 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 PGA5P0DJD9 388 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 PTHLHP12272 177 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 MGMTP16455 207 aa3.89□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms