RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 MYL9P24844 172 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 LOXL3P58215 753 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 OR52M1Q8NGK5 317 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 SOCS1O15524 211 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 RAB3BP20337 219 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 C6orf183Q5T699 404 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 SHISA2Q6UWI4 295 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 NR2C2APQ86WQ0 139 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 RAB18Q9NP72 206 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 GFOD1Q9NXC2 390 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 IFITM5A6NNB3 132 aa16.84■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 CEACAM3P40198 252 aa16.84■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 GNG10P50151 68 aa16.84■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 TMEM50BP56557 158 aa16.84■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 PLA2G7Q13093 441 aa16.84■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 NEDD8Q15843 81 aa16.84■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 TRAT1Q6PIZ9 186 aa16.84■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 TMEM219Q86XT9 240 aa16.84■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 OR1L1Q8NH94 360 aa16.84■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 OR51E2Q9H255 320 aa16.84■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 RNF114Q9Y508 228 aa16.84■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa16.83■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa16.83■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PPE3 182 aa16.83■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 SPINT2O43291 252 aa16.83■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 HBZP02008 142 aa16.83■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 IGHV3-43DP0DP04 118 aa16.83■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 RANBP1P43487 201 aa16.83■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 PROK1P58294 105 aa16.83■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 C5orf24Q7Z6I8 188 aa16.83■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 WFDC12Q8WWY7 111 aa16.83■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 TAF9BQ9HBM6 251 aa16.83■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa16.83■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 PITPNC1Q9UKF7 332 aa16.83■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 SSR3Q9UNL2 185 aa16.83■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 OOSP1A8MZH6 123 aa16.82■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 RRP9O43818 475 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 TNFAIP8O95379 198 aa16.82■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 CD24P25063 80 aa16.82■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 BRS3P32247 399 aa16.82■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 VEGFCP49767 419 aa16.82■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP10-3P60369 221 aa16.82■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa16.82■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 LINC00311Q8N616 119 aa16.82■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 C8orf31Q8N9H6 132 aa16.82■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 RAB9BQ9NP90 201 aa16.82■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 RAB22AQ9UL26 194 aa16.82■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 HSF4Q9ULV5 492 aa16.82■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 NAPSAO96009 420 aa16.81■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 KIR2DS4P43632 304 aa16.81■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 EFNB2P52799 333 aa16.81■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 TMEM30BQ3MIR4 351 aa16.81■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 Q3ZCU0 254 aa16.81■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 FBLN7Q53RD9 439 aa16.81■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 Q6ZPA2 131 aa16.81■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 ZNF554Q86TJ5 538 aa16.81■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 PRR18Q8N4B5 295 aa16.81■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 RPEQ96AT9 228 aa16.81■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 KCNIP1Q9NZI2 227 aa16.81■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 SIGLEC9Q9Y336 463 aa16.81■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 A0A087WXM4 84 aa16.8■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 A0A0B4J203 849 aa16.8■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 SMIM30A4D0T7 59 aa16.8■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 CD36P16671 472 aa16.8■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 GADD45AP24522 165 aa16.8■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 ARHGDIBP52566 201 aa16.8■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 MADCAM1Q13477 382 aa16.8■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa16.8■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 ZNF880Q6PDB4 577 aa16.8■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 TPRA1Q86W33 373 aa16.8■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 ZNF439Q8NDP4 499 aa16.8■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 TSPAN14Q8NG11 270 aa16.8■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 OR4C13Q8NGP0 309 aa16.8■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 OR10X1Q8NGY0 326 aa16.8■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 TOMM40LQ969M1 308 aa16.8■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa16.8■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 OCSTAMPQ9BR26 566 aa16.8■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa16.8■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa16.8■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 RNF167Q9H6Y7 350 aa16.8■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 LIN7BQ9HAP6 207 aa16.8■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 AK3Q9UIJ7 227 aa16.8■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 NOTOA8MTQ0 251 aa16.79■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 SLC31A2O15432 143 aa16.79■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 MNDAP41218 407 aa16.79■□□□□ 0.28
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