RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477529.1

SRRT-210, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 540 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-210ENST00000477529 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
SRRT-210ENST00000477529 LEUTXA8MZ59 168 aa11.32□□□□□ -0.6
SRRT-210ENST00000477529 H3BUI4 141 aa11.32□□□□□ -0.6
SRRT-210ENST00000477529 F2RL2O00254 374 aa11.32□□□□□ -0.6
SRRT-210ENST00000477529 TOR1AO14656 332 aa11.32□□□□□ -0.6
SRRT-210ENST00000477529 LDLRAD4O15165 306 aa11.32□□□□□ -0.6
SRRT-210ENST00000477529 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
SRRT-210ENST00000477529 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
SRRT-210ENST00000477529 PRRX1P54821 245 aa11.32□□□□□ -0.6
SRRT-210ENST00000477529 PROK1P58294 105 aa11.32□□□□□ -0.6
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SRRT-210ENST00000477529 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa11.32□□□□□ -0.6
SRRT-210ENST00000477529 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
SRRT-210ENST00000477529 Q6ZPA2 131 aa11.32□□□□□ -0.6
SRRT-210ENST00000477529 FAM89BQ8N5H3 189 aa11.32□□□□□ -0.6
SRRT-210ENST00000477529 OR52M1Q8NGK5 317 aa11.32□□□□□ -0.6
SRRT-210ENST00000477529 CREB3L1Q96BA8 519 aa11.32□□□□□ -0.6
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SRRT-210ENST00000477529 C16orf95Q9H693 158 aa11.32□□□□□ -0.6
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SRRT-210ENST00000477529 STEAP1Q9UHE8 339 aa11.32□□□□□ -0.6
SRRT-210ENST00000477529 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa11.32□□□□□ -0.6
SRRT-210ENST00000477529 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
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SRRT-210ENST00000477529 NOTCH3Q9UM47 2321 aa11.32□□□□□ -0.6
SRRT-210ENST00000477529 CMYA5Q8N3K9 4069 aa11.32□□□□□ -0.6
SRRT-210ENST00000477529 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa11.31□□□□□ -0.6
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SRRT-210ENST00000477529 A0A1W2PPE3 182 aa11.31□□□□□ -0.6
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SRRT-210ENST00000477529 SOCS1O15524 211 aa11.31□□□□□ -0.6
SRRT-210ENST00000477529 IGHV3-43DP0DP04 118 aa11.31□□□□□ -0.6
SRRT-210ENST00000477529 RAB3BP20337 219 aa11.31□□□□□ -0.6
SRRT-210ENST00000477529 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
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SRRT-210ENST00000477529 PSMD7P51665 324 aa11.31□□□□□ -0.6
SRRT-210ENST00000477529 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
SRRT-210ENST00000477529 PLA2G7Q13093 441 aa11.31□□□□□ -0.6
SRRT-210ENST00000477529 TRAT1Q6PIZ9 186 aa11.31□□□□□ -0.6
SRRT-210ENST00000477529 SHISA2Q6UWI4 295 aa11.31□□□□□ -0.6
SRRT-210ENST00000477529 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa11.31□□□□□ -0.6
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SRRT-210ENST00000477529 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
SRRT-210ENST00000477529 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
SRRT-210ENST00000477529 GFOD1Q9NXC2 390 aa11.31□□□□□ -0.6
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SRRT-210ENST00000477529 SMIM30A4D0T7 59 aa11.3□□□□□ -0.6
SRRT-210ENST00000477529 IFITM5A6NNB3 132 aa11.3□□□□□ -0.6
SRRT-210ENST00000477529 OOSP1A8MZH6 123 aa11.3□□□□□ -0.6
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SRRT-210ENST00000477529 OR1L1Q8NH94 360 aa11.3□□□□□ -0.6
SRRT-210ENST00000477529 TOMM40LQ969M1 308 aa11.3□□□□□ -0.6
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SRRT-210ENST00000477529 SPINT2O43291 252 aa11.29□□□□□ -0.6
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SRRT-210ENST00000477529 CD24P25063 80 aa11.29□□□□□ -0.6
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SRRT-210ENST00000477529 MADCAM1Q13477 382 aa11.29□□□□□ -0.6
SRRT-210ENST00000477529 HMGN3Q15651 99 aa11.29□□□□□ -0.6
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SRRT-210ENST00000477529 C5orf24Q7Z6I8 188 aa11.29□□□□□ -0.6
SRRT-210ENST00000477529 LINC00311Q8N616 119 aa11.29□□□□□ -0.6
SRRT-210ENST00000477529 C8orf31Q8N9H6 132 aa11.29□□□□□ -0.6
SRRT-210ENST00000477529 OR10X1Q8NGY0 326 aa11.29□□□□□ -0.6
SRRT-210ENST00000477529 ZNF702PQ9H963 129 aa11.29□□□□□ -0.6
SRRT-210ENST00000477529 LIN7BQ9HAP6 207 aa11.29□□□□□ -0.6
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SRRT-210ENST00000477529 GADD45AP24522 165 aa11.28□□□□□ -0.6
SRRT-210ENST00000477529 BRS3P32247 399 aa11.28□□□□□ -0.6
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SRRT-210ENST00000477529 VEGFCP49767 419 aa11.28□□□□□ -0.6
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SRRT-210ENST00000477529 Q3ZCU0 254 aa11.28□□□□□ -0.6
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SRRT-210ENST00000477529 ZNF880Q6PDB4 577 aa11.28□□□□□ -0.6
SRRT-210ENST00000477529 CFHR4Q92496 578 aa11.28□□□□□ -0.6
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SRRT-210ENST00000477529 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa11.28□□□□□ -0.6
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