RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 TRAT1Q6PIZ9 186 aa14.54□□□□□ -0.08
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HERC3-205ENST00000426683 MMP28Q9H239 520 aa14.54□□□□□ -0.08
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HERC3-205ENST00000426683 VCX3AQ9NNX9 186 aa14.54□□□□□ -0.08
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HERC3-205ENST00000426683 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-205ENST00000426683 TCF19Q9Y242 345 aa14.54□□□□□ -0.08
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HERC3-205ENST00000426683 F2RL2O00254 374 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-205ENST00000426683 SPINT2O43291 252 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-205ENST00000426683 IGHV3-43DP0DP04 118 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-205ENST00000426683 CEACAM3P40198 252 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-205ENST00000426683 VEGFCP49767 419 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-205ENST00000426683 DYNLT3P51808 116 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-205ENST00000426683 PLA2G7Q13093 441 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-205ENST00000426683 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa14.53□□□□□ -0.08
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HERC3-205ENST00000426683 PRR18Q8N4B5 295 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-205ENST00000426683 OR52M1Q8NGK5 317 aa14.53□□□□□ -0.08
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HERC3-205ENST00000426683 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
HERC3-205ENST00000426683 GFOD1Q9NXC2 390 aa14.53□□□□□ -0.08
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HERC3-205ENST00000426683 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
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HERC3-205ENST00000426683 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa14.52□□□□□ -0.09
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HERC3-205ENST00000426683 A0A1W2PPE3 182 aa14.52□□□□□ -0.09
HERC3-205ENST00000426683 POM121CA8CG34 1229 aa14.52□□□□□ -0.09
HERC3-205ENST00000426683 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
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HERC3-205ENST00000426683 MNDAP41218 407 aa14.49□□□□□ -0.09
HERC3-205ENST00000426683 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
HERC3-205ENST00000426683 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
HERC3-205ENST00000426683 OR2S2Q9NQN1 319 aa14.49□□□□□ -0.09
HERC3-205ENST00000426683 DAPK2Q9UIK4 370 aa14.49□□□□□ -0.09
HERC3-205ENST00000426683 RNF114Q9Y508 228 aa14.49□□□□□ -0.09
HERC3-205ENST00000426683 TRIM64CA6NLI5 447 aa14.48□□□□□ -0.09
HERC3-205ENST00000426683 CLEC2LP0C7M8 214 aa14.48□□□□□ -0.09
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