RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBALD1Q8TB05 177 aa10.28□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARL11Q969Q4 196 aa10.28□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa10.28□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LGALS12Q96DT0 336 aa10.28□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q9H521 79 aa10.28□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IFT22Q9H7X7 185 aa10.28□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF580Q9UK33 172 aa10.28□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ST3GAL6Q9Y274 331 aa10.28□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa10.28□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BIRC6Q9NR09 4857 aa10.27□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa10.27□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNTNA6NMZ2 147 aa10.27□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TXNL1O43396 289 aa10.27□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LY86O95711 162 aa10.27□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGF1P05019 195 aa10.27□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGHV3-43DP0DP04 118 aa10.27□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SOX6P35712 828 aa10.27□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 INSL3P51460 131 aa10.27□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBM11P57052 281 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NHLRC3Q5JS37 347 aa10.27□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYOZ3Q8TDC0 251 aa10.27□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCTD7Q96MP8 289 aa10.27□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 JAM3Q9BX67 310 aa10.27□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAS2R4Q9NYW5 299 aa10.27□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL36GQ9NZH8 169 aa10.27□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 E9PI62 339 aa10.26□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC31A2O15432 143 aa10.26□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ORC5O43913 435 aa10.26□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDRT1O95170 752 aa10.26□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR5H8P0DN80 308 aa10.26□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MED21Q13503 144 aa10.26□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q3ZCU0 254 aa10.26□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC00596Q86U02 117 aa10.26□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC107Q8WV48 283 aa10.26□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RCHY1Q96PM5 261 aa10.26□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C8orf4Q9NR00 106 aa10.26□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BATF3Q9NR55 127 aa10.26□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAB26Q9ULW5 256 aa10.26□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CSMD3Q7Z407 3707 aa10.25□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CSTBP04080 98 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALPLP05186 524 aa10.25□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR8U8P0C7N1 319 aa10.25□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SOX2P48431 317 aa10.25□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF137PP52743 207 aa10.25□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 F2RL1P55085 397 aa10.25□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MPV17LQ2QL34 196 aa10.25□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASPHD1Q5U4P2 390 aa10.25□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PACRGLQ8N7B6 248 aa10.25□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR52N1Q8NH53 320 aa10.25□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBE2E2Q96LR5 201 aa10.25□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C9orf16Q9BUW7 83 aa10.25□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 METTL9Q9H1A3 318 aa10.25□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GNB4Q9HAV0 340 aa10.25□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ISYNA1Q9NPH2 558 aa10.25□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AASSQ9UDR5 926 aa10.25□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ORC6Q9Y5N6 252 aa10.25□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAGEA13PA6NCF6 341 aa10.24□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 I3L521 148 aa10.24□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AIPO00170 330 aa10.24□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EI24O14681 340 aa10.24□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SERPINA2P20848 420 aa10.24□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYF6P23409 242 aa10.24□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RUNX1Q01196 453 aa10.24□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF616Q08AN1 781 aa10.24□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATAD3CQ5T2N8 411 aa10.24□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF497Q6ZNH5 498 aa10.24□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SBSPONQ8IVN8 264 aa10.24□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF439Q8NDP4 499 aa10.24□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR1N2Q8NGR9 330 aa10.24□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NEK7Q8TDX7 302 aa10.24□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa10.24□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERVK13-1Q9NX77 482 aa10.24□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ING4Q9UNL4 249 aa10.24□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TENM2Q9NT68 2774 aa10.24□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SORL1Q92673 2214 aa10.24□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C12orf77C9JDV5 145 aa10.23□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DENRO43583 198 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FADS2O95864 444 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MT-ND4P03905 459 aa10.23□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD2P06729 351 aa10.23□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GABRB1P18505 474 aa10.23□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPIFP30405 207 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GNB1P62873 340 aa10.23□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LSAMPQ13449 338 aa10.23□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MMDQ15546 238 aa10.23□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM30BQ3MIR4 351 aa10.23□□□□□ -0.77
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms