RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 P2RY14Q15391 338 aa15.67■□□□□ 0.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 C11orf88Q6PI97 169 aa15.67■□□□□ 0.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 SVOPQ8N4V2 548 aa15.67■□□□□ 0.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNG3Q8TAE7 436 aa15.67■□□□□ 0.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 TOMM40LQ969M1 308 aa15.67■□□□□ 0.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPEQ96AT9 228 aa15.67■□□□□ 0.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 SULT4A1Q9BR01 284 aa15.67■□□□□ 0.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 GFOD1Q9NXC2 390 aa15.67■□□□□ 0.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa15.67■□□□□ 0.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A0A6YYD4 124 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1W2PPI3 338 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 H3BUI4 141 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHV3-43DP0DP04 118 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 MADCAM1Q13477 382 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 C6orf183Q5T699 404 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBE2UQ5VVX9 321 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPARTQ8N0X7 666 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLHDC1Q8N7A1 406 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 LIN7BQ9HAP6 207 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLGRKTQ9HBL7 147 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 SHISA3A0PJX4 238 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 HBZP02008 142 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 MNDAP41218 407 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 BLCAPP62952 87 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB11BQ15907 218 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRAT1Q6PIZ9 186 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q6ZS46 218 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 C16orf82Q7Z2V1 217 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2W3Q7Z3T1 314 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 LINC00311Q8N616 119 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 C8orf31Q8N9H6 132 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR1L1Q8NH94 360 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 NEDD4LQ96PU5 975 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 LPAR5Q9H1C0 372 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 SERTAD4Q9NUC0 356 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 VWFP04275 2813 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 TIMM23O14925 209 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPINT2O43291 252 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARSBP15848 533 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLDN12P56749 244 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 HERPUD1Q15011 391 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM30BQ3MIR4 351 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 TREML4Q6UXN2 200 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 C6orf201Q7Z4U5 140 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 DTX3Q8N9I9 347 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF439Q8NDP4 499 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR10X1Q8NGY0 326 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 CFHR4Q92496 578 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC25A33Q9BSK2 321 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRSS22Q9GZN4 317 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 M0QZ24 198 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 HSD17B6O14756 317 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC31A2O15432 143 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2F2O95006 317 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q3ZCU0 254 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRR18Q8N4B5 295 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 DRAM1Q8N682 238 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR56B4Q8NH76 319 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAAP24Q9BTP7 215 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAF9BQ9HBM6 251 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB9BQ9NP90 201 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC42Q9Y546 428 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 V9GY05 133 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCRL2O00421 344 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 VSIG10L2P0DP72 767 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSMB9P28065 219 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB7AP51149 207 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM95Q3KNT9 176 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q6ZPA2 131 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 C5orf24Q7Z6I8 188 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF554Q86TJ5 538 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR8H3Q8N146 312 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR51D1Q8NGF3 324 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR10V1Q8NGI7 309 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 CAPSLQ8WWF8 208 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 FCGR1BQ92637 280 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM3DQ96BQ1 224 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 AKR1E2Q96JD6 320 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 OCSTAMPQ9BR26 566 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 GNG12Q9UBI6 72 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 LDLRAD4O15165 306 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 SOCS1O15524 211 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR10A3P58181 314 aa15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms