RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 TAAR3PQ9P1P4 343 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS1-201ENST00000311008 MED13Q9UHV7 2174 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS1-201ENST00000311008 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
SPNS1-201ENST00000311008 COLCA2A8K830 154 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS1-201ENST00000311008 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
SPNS1-201ENST00000311008 SH2D1BO14796 132 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS1-201ENST00000311008 OR2H2O95918 312 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS1-201ENST00000311008 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
SPNS1-201ENST00000311008 PGA5P0DJD9 388 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS1-201ENST00000311008 CD200P41217 278 aa16.6■□□□□ 0.25
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SPNS1-201ENST00000311008 OR2J1Q9GZK6 312 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS1-201ENST00000311008 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS1-201ENST00000311008 IQCF6A8MYZ5 107 aa16.59■□□□□ 0.25
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SPNS1-201ENST00000311008 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
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SPNS1-201ENST00000311008 IGHV1-2P23083 117 aa16.58■□□□□ 0.25
SPNS1-201ENST00000311008 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa16.58■□□□□ 0.25
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SPNS1-201ENST00000311008 HIPK2Q9H2X6 1198 aa16.58■□□□□ 0.25
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SPNS1-201ENST00000311008 WIPI2Q9Y4P8 454 aa16.58■□□□□ 0.25
SPNS1-201ENST00000311008 R4GN57 208 aa16.58■□□□□ 0.25
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SPNS1-201ENST00000311008 NXPH2O95156 264 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-201ENST00000311008 PSG2P11465 335 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-201ENST00000311008 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
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SPNS1-201ENST00000311008 PAX9P55771 341 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-201ENST00000311008 TESK1Q15569 626 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-201ENST00000311008 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-201ENST00000311008 AWAT1Q58HT5 328 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-201ENST00000311008 ODF3L1Q8IXM7 274 aa16.57■□□□□ 0.24
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SPNS1-201ENST00000311008 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-201ENST00000311008 SULT1A1P50225 295 aa16.57■□□□□ 0.24
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SPNS1-201ENST00000311008 SLC25A40Q8TBP6 338 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-201ENST00000311008 FBXO7Q9Y3I1 522 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-201ENST00000311008 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-201ENST00000311008 KNTC1P50748 2209 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-201ENST00000311008 C7orf77A4D0Y5 90 aa16.56■□□□□ 0.24
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SPNS1-201ENST00000311008 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM217Q8N7C4 229 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-201ENST00000311008 KIAA1456Q9P272 454 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-201ENST00000311008 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-201ENST00000311008 M0R036 132 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-201ENST00000311008 CDIPTO14735 213 aa16.55■□□□□ 0.24
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SPNS1-201ENST00000311008 TLE4Q04727 773 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-201ENST00000311008 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-201ENST00000311008 C14orf79Q96F83 325 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-201ENST00000311008 TUBG2Q9NRH3 451 aa16.55■□□□□ 0.24
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SPNS1-201ENST00000311008 RBFOX3A6NFN3 312 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-201ENST00000311008 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-201ENST00000311008 IGLV2-14P01704 120 aa16.55■□□□□ 0.24
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SPNS1-201ENST00000311008 SPINK2P20155 84 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-201ENST00000311008 RAB5BP61020 215 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-201ENST00000311008 AKIRIN2Q53H80 203 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-201ENST00000311008 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-201ENST00000311008 VASH2Q86V25 355 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-201ENST00000311008 CLCC1Q96S66 551 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-201ENST00000311008 CBR1P16152 277 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-201ENST00000311008 HOXC12P31275 282 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-201ENST00000311008 SOHLH1Q5JUK2 328 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-201ENST00000311008 SPSB3Q6PJ21 355 aa16.54■□□□□ 0.24
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