RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296031.4

CXCL2-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2-201ENST00000296031 J3QR06 171 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 F2RL2O00254 374 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 LIAT1Q6ZQX7 453 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 TSPAN14Q8NG11 270 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 OR52M1Q8NGK5 317 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF747Q9BV97 191 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 OR51E2Q9H255 320 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 RAB18Q9NP72 206 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 RAB9BQ9NP90 201 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 TCF19Q9Y242 345 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 A0A087WXM4 84 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 LY6LH3BQJ8 138 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 LDLRAD4O15165 306 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 SPINT2O43291 252 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 OLFML2AQ68BL7 652 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 TRAT1Q6PIZ9 186 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 PRR18Q8N4B5 295 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 CLPSL1A2RUU4 121 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 SMIM30A4D0T7 59 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 SOCS1O15524 211 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 IGHV3-43DP0DP04 118 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 CD36P16671 472 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 NR2C2APQ86WQ0 139 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 TMEM219Q86XT9 240 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 LINC01006Q8NI28 216 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 PITPNC1Q9UKF7 332 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa20.1■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 A0A1W2PPE3 182 aa20.1■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 A6NDX4 124 aa20.1■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 CHST1O43916 411 aa20.1■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 TSPAN9O75954 239 aa20.1■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 ARHGDIBP52566 201 aa20.1■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 LOXL3P58215 753 aa20.1■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 OR1L1Q8NH94 360 aa20.1■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa20.1■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 C16orf95Q9H693 158 aa20.1■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 TAF9BQ9HBM6 251 aa20.1■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 GFOD1Q9NXC2 390 aa20.1■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 KCNIP1Q9NZI2 227 aa20.1■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 RAB22AQ9UL26 194 aa20.1■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 OOSP1A8MZH6 123 aa20.09■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 HBZP02008 142 aa20.09■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 GADD45AP24522 165 aa20.09■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 BRS3P32247 399 aa20.09■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 VEGFCP49767 419 aa20.09■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 PLA2G7Q13093 441 aa20.09■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 TMEM30BQ3MIR4 351 aa20.09■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF554Q86TJ5 538 aa20.09■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 TPRA1Q86W33 373 aa20.09■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 RPEQ96AT9 228 aa20.09■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 KCTD7Q96MP8 289 aa20.09■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF696Q9H7X3 374 aa20.09■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 LIN7BQ9HAP6 207 aa20.09■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 VCX3AQ9NNX9 186 aa20.09■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 HSF4Q9ULV5 492 aa20.09■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 RNF114Q9Y508 228 aa20.09■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 TMEM50BP56557 158 aa20.08■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 MADCAM1Q13477 382 aa20.08■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa20.08■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 SHISA2Q6UWI4 295 aa20.08■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 OR56B1Q8NGI3 324 aa20.08■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 OR10X1Q8NGY0 326 aa20.08■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 TOMM40LQ969M1 308 aa20.08■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 A0A0B4J203 849 aa20.07■□□□□ 0.8
CXCL2-201ENST00000296031 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa20.07■□□□□ 0.8
CXCL2-201ENST00000296031 NOTOA8MTQ0 251 aa20.07■□□□□ 0.8
CXCL2-201ENST00000296031 NAPSAO96009 420 aa20.07■□□□□ 0.8
CXCL2-201ENST00000296031 CD24P25063 80 aa20.07■□□□□ 0.8
CXCL2-201ENST00000296031 MNDAP41218 407 aa20.07■□□□□ 0.8
CXCL2-201ENST00000296031 Q6ZTK2 550 aa20.07■□□□□ 0.8
CXCL2-201ENST00000296031 C8orf31Q8N9H6 132 aa20.07■□□□□ 0.8
CXCL2-201ENST00000296031 OR4C13Q8NGP0 309 aa20.07■□□□□ 0.8
CXCL2-201ENST00000296031 GNG12Q9UBI6 72 aa20.07■□□□□ 0.8
CXCL2-201ENST00000296031 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
CXCL2-201ENST00000296031 EFNB2P52799 333 aa20.06■□□□□ 0.8
CXCL2-201ENST00000296031 Q3ZCU0 254 aa20.06■□□□□ 0.8
CXCL2-201ENST00000296031 C5orf24Q7Z6I8 188 aa20.06■□□□□ 0.8
CXCL2-201ENST00000296031 LINC00311Q8N616 119 aa20.06■□□□□ 0.8
CXCL2-201ENST00000296031 OR10V1Q8NGI7 309 aa20.06■□□□□ 0.8
CXCL2-201ENST00000296031 WFDC12Q8WWY7 111 aa20.06■□□□□ 0.8
CXCL2-201ENST00000296031 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa20.06■□□□□ 0.8
CXCL2-201ENST00000296031 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa20.06■□□□□ 0.8
CXCL2-201ENST00000296031 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
CXCL2-201ENST00000296031 AK3Q9UIJ7 227 aa20.06■□□□□ 0.8
CXCL2-201ENST00000296031 RAB6AP20340 208 aa20.05■□□□□ 0.8
CXCL2-201ENST00000296031 SDC2P34741 201 aa20.05■□□□□ 0.8
CXCL2-201ENST00000296031 PLAC9Q5JTB6 97 aa20.05■□□□□ 0.8
CXCL2-201ENST00000296031 SETD6Q8TBK2 473 aa20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.7 ms