RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000055006.11

Trim16-201, Transcript of Tripartite motif-containing protein 16, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trim16, Length 3,906 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gm8265K7N6Y8 158 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Vmn2r60L7N2A1 853 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Atf6bO35451 699 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Tlx3O55144 291 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 MscO88940 201 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Ifna1P01572 189 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 P01654 111 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 P01656 111 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 P03977 111 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Ca3P16015 260 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 CluQ06890 448 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Fthl17dQ3SXD1 176 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gm10644Q3TZG3 87 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 VwceQ3U515 929 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Rnf144bQ8BKD6 301 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Vmn1r193Q8R258 319 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Ddit4lQ8VHZ5 193 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Fthl17Q99MX2 176 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Pop4Q9CR08 221 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 1700029F12RikQ9CRB4 147 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Slc25a22Q9D6M3 323 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Samd8Q9DA37 478 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Fzd5Q9EQD0 585 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Plekha3Q9ERS4 297 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Tnrc18Q80WC3 2878 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Fthl17bA2AHC5 176 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Fthl17cA2AHC6 176 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gm13547A2ARC0 163 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Scgb1b29D2XZ31 93 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Scgb1b20E9PWZ2 93 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Zfp688E9Q5M9 274 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Hmgb3O54879 200 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Amy2P00688 508 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Csf3P09920 208 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Drd3P30728 446 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Apoc1P34928 88 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Cxcl12P40224 93 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Ccr1l1P51676 356 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Rab2aP53994 212 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Il9rQ01114 468 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Fthl17fQ3SXD2 176 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Btn1a1Q62556 524 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Tas2r120Q7M721 295 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Faap24Q8BHL6 221 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Sdhaf4Q8BTE0 104 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 PigtQ8BXQ2 582 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 SccpdhQ8R127 429 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Nt5mQ8VCE6 220 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Acer2Q8VD53 275 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr129Q8VEY1 330 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr536Q8VFE9 307 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr796Q8VGJ1 310 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr642Q924X8 314 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Rab5aQ9CQD1 215 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 PinlypQ9CQD7 212 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Rpusd4Q9CWX4 377 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 TsfmQ9CZR8 324 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Asb5Q9D1A4 329 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Marveld3Q9D956 376 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Mcts1Q9DB27 181 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr957Q9EQB7 311 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Psmb3Q9R1P1 205 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Pfdn5Q9WU28 154 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Ighv1-54A0A075B5W5 117 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Trav15d-1-dv6d-1A0A075B624 124 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Ighv14-4A0A0A6YVR1 117 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr1438-ps1A0A140LHS9 319 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Ube2dnl2A2AFH2 155 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gm12790B1AUV6 201 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gm10260F6YVP7 152 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 G530012D18RikJ3QK25 139 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gm21976J3QNN2 249 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Siva1O54926 175 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Ifitm5O88728 134 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Lyz2P08905 148 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 F13bQ07968 669 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Wfdc6aQ3UW55 136 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 A3galt2Q3V1N9 370 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Tmprss13Q5U405 543 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Ell3Q80VR2 395 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Arf2Q8BSL7 181 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Spem2Q8C5U4 503 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Parp11Q8CFF0 331 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Vmn1r36Q8R2E3 305 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr350Q8VFP8 312 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr922Q8VG50 311 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 DohhQ99LN9 302 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Tmem175Q9CXY1 499 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Ints1Q6P4S8 2195 aa6.85□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gm13723A0A1L1SUP2 315 aa6.84□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Fndc7A2AED3 737 aa6.84□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Tmem200bD3Z0P8 284 aa6.84□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Yjefn3F6W8I0 251 aa6.84□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gm5225J3QPL3 108 aa6.84□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 EndogO08600 294 aa6.84□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Tcn2O88968 430 aa6.84□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Igsf11P0C673 428 aa6.84□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 PdgfbP31240 241 aa6.84□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Polr2gP62488 172 aa6.84□□□□□ -1.31
Trim16-201ENSMUST00000055006 Ppp1ccP63087 323 aa6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.5 ms