Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5W5

Ighv1-54, Immunoglobulin heavy variable V1-54 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-54A0A075B5W5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Ighv1-54A0A075B5W5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ighv1-54A0A075B5W5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ighv1-54A0A075B5W5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ighv1-54A0A075B5W5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ighv1-54A0A075B5W5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ighv1-54A0A075B5W5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Ighv1-54A0A075B5W5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Ighv1-54A0A075B5W5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Ighv1-54A0A075B5W5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ighv1-54A0A075B5W5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Ighv1-54A0A075B5W5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ighv1-54A0A075B5W5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ighv1-54A0A075B5W5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ighv1-54A0A075B5W5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ighv1-54A0A075B5W5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ighv1-54A0A075B5W5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ighv1-54A0A075B5W5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ighv1-54A0A075B5W5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ighv1-54A0A075B5W5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ighv1-54A0A075B5W5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ighv1-54A0A075B5W5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ighv1-54A0A075B5W5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ighv1-54A0A075B5W5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ighv1-54A0A075B5W5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ighv1-54A0A075B5W5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ighv1-54A0A075B5W5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ighv1-54A0A075B5W5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ighv1-54A0A075B5W5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ighv1-54A0A075B5W5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ighv1-54A0A075B5W5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ighv1-54A0A075B5W5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ighv1-54A0A075B5W5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ighv1-54A0A075B5W5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ighv1-54A0A075B5W5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ighv1-54A0A075B5W5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ighv1-54A0A075B5W5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ighv1-54A0A075B5W5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ighv1-54A0A075B5W5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ighv1-54A0A075B5W5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ighv1-54A0A075B5W5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ighv1-54A0A075B5W5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ighv1-54A0A075B5W5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ighv1-54A0A075B5W5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ighv1-54A0A075B5W5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ighv1-54A0A075B5W5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ighv1-54A0A075B5W5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ighv1-54A0A075B5W5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ighv1-54A0A075B5W5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ighv1-54A0A075B5W5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ighv1-54A0A075B5W5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ighv1-54A0A075B5W5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ighv1-54A0A075B5W5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ighv1-54A0A075B5W5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ighv1-54A0A075B5W5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ighv1-54A0A075B5W5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ighv1-54A0A075B5W5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ighv1-54A0A075B5W5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ighv1-54A0A075B5W5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ighv1-54A0A075B5W5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ighv1-54A0A075B5W5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ighv1-54A0A075B5W5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ighv1-54A0A075B5W5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ighv1-54A0A075B5W5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ighv1-54A0A075B5W5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ighv1-54A0A075B5W5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ighv1-54A0A075B5W5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ighv1-54A0A075B5W5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ighv1-54A0A075B5W5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ighv1-54A0A075B5W5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ighv1-54A0A075B5W5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ighv1-54A0A075B5W5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ighv1-54A0A075B5W5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ighv1-54A0A075B5W5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ighv1-54A0A075B5W5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ighv1-54A0A075B5W5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ighv1-54A0A075B5W5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ighv1-54A0A075B5W5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ighv1-54A0A075B5W5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ighv1-54A0A075B5W5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ighv1-54A0A075B5W5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ighv1-54A0A075B5W5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ighv1-54A0A075B5W5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ighv1-54A0A075B5W5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ighv1-54A0A075B5W5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ighv1-54A0A075B5W5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ighv1-54A0A075B5W5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ighv1-54A0A075B5W5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ighv1-54A0A075B5W5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ighv1-54A0A075B5W5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ighv1-54A0A075B5W5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ighv1-54A0A075B5W5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ighv1-54A0A075B5W5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ighv1-54A0A075B5W5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ighv1-54A0A075B5W5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ighv1-54A0A075B5W5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ighv1-54A0A075B5W5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ighv1-54A0A075B5W5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ighv1-54A0A075B5W5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ighv1-54A0A075B5W5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
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