RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556838.5

RBM23-223, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 2

Gene RBM23, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-223	ENST00000556838	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	ETAA1	Q9NY74	926 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	DPM3	Q9P2X0	92 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	AIP	O00170	330 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	SLC17A2	O00624	439 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	ORC5	O43913	435 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	VSIG8	P0DPA2	414 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	MYL9	P24844	172 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	RELB	Q01201	579 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	RAB11B	Q15907	218 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	SSX1	Q16384	188 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	C6orf183	Q5T699	404 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	OR9G1	Q8NH87	305 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	FAM46B	Q96A09	425 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	KIRREL1	Q96J84	757 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	OOSP1	A8MZH6	123 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	TSPAN9	O75954	239 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	IGLV1-47	P01700	117 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	ARSB	P15848	533 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	PAX6	P26367	422 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	PSMB9	P28065	219 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	BRS3	P32247	399 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	GDNF	P39905	211 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	LY6E	Q16553	131 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	PLA1A	Q53H76	456 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	RFESD	Q8TAC1	157 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	PIFO	Q8TCI5	191 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	CCDC107	Q8WV48	283 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	ARL11	Q969Q4	196 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	TM2D1	Q9BX74	207 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	C16orf95	Q9H693	158 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838		V9GY05	133 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	FAM172BP	A6NC97	362 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838		J3QR06	171 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	F2RL2	O00254	374 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	SPINT2	O43291	252 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	SSTR5	P35346	364 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	MNDA	P41218	407 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	QRFP	P83859	136 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	LTC4S	Q16873	150 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	OR10K2	Q6IF99	312 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	GAPT	Q8N292	157 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	9.99	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	MMP28	Q9H239	520 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	TCF19	Q9Y242	345 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	RNF114	Q9Y508	228 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		9.98	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	UBE2QL1	A1L167	161 aa		9.98	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	C15orf65	H3BRN8	121 aa		9.98	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	CHAT	P28329	748 aa		9.98	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	RAB13	P51153	203 aa		9.98	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	UNC119	Q13432	240 aa		9.98	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	P2RY14	Q15391	338 aa		9.98	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838		Q3ZCU0	254 aa		9.98	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		9.98	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		9.98	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	C22orf42	Q6IC83	251 aa		9.98	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838		Q6ZSV7	163 aa		9.98	□□□□□ -0.81
RBM23-223	ENST00000556838	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		9.98	□□□□□ -0.81

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