RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530199.5

SVIP-204, Transcript of small VCP interacting protein, human

TSL 2

Gene SVIP, Length 549 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SVIP-204	ENST00000530199	MAGEA12	P43365	314 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	SERPINB8	P50452	374 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	SLC25A1	P53007	311 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	SLC35B1	P78383	322 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	CD300C	Q08708	224 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	SYPL1	Q16563	259 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	LINC01620	Q4KN68	170 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	LIN52	Q52LA3	116 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	ANKFN1	Q8N957	763 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	BEST4	Q8NFU0	473 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	OR5J2	Q8NH18	312 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	SLC22A4	Q9H015	551 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	MLX	Q9UH92	298 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	GMNC	A6NCL1	334 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	C11orf98	E9PRG8	122 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	TYROBP	O43914	113 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	CLU	P10909	449 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	COX7A1	P24310	79 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	LAP3	P28838	519 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	MFAP2	P55001	183 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	SGCA	Q16586	387 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	DGUOK	Q16854	277 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	STUM	Q69YW2	141 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	OR11H1	Q8NG94	326 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	RNF213	Q63HN8	5207 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	TMEM114	B3SHH9	223 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	LRRN3	E7EW58	273 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	OVOL1	O14753	267 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	GMDS	O60547	372 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	SLC2A10	O95528	541 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	ANP32D	O95626	131 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	NEFH	P12036	1026 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	BGN	P21810	368 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	TCTA	P57738	103 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	OR12D2	P58182	307 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	SPIB	Q01892	262 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	TMEM106A	Q96A25	262 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	TUBA4B	Q9H853	241 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SVIP-204	ENST00000530199		A0A1B0GWA3	101 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	RNF13	O43567	381 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	ARG1	P05089	322 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	NR2C1	P13056	603 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	ACADS	P16219	412 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	TAC1	P20366	129 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	MT3	P25713	68 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	RUNX1	Q01196	453 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	OR8G1	Q15617	311 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	UBE2V2	Q15819	145 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	C14orf177	Q52M58	125 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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