RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 GPR176Q14439 515 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-218ENST00000511185 SSX1Q16384 188 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-218ENST00000511185 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF497Q6ZNH5 498 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-218ENST00000511185 LIAT1Q6ZQX7 453 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-218ENST00000511185 MGLLQ99685 303 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-218ENST00000511185 NICN1Q9BSH3 213 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-218ENST00000511185 MMP28Q9H239 520 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-218ENST00000511185 DPM3Q9P2X0 92 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-218ENST00000511185 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 LY6LH3BQJ8 138 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 AIPO00170 330 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 IGHV3-43DP0DP04 118 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 SRMP19623 302 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM95Q3KNT9 176 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 Q6ZS46 218 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF367Q7RTV3 350 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 C5orf24Q7Z6I8 188 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF565Q8N9K5 539 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 OR9G1Q8NH87 305 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF696Q9H7X3 374 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 RAB18Q9NP72 206 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 ISYNA1Q9NPH2 558 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 ACOT13Q9NPJ3 140 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 FBLN5Q9UBX5 448 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 PSG11Q9UQ72 335 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM90A22PA8MWA6 464 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 J3QR06 171 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 TOR1AO14656 332 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 P2RY14Q15391 338 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 NKAPLQ5M9Q1 402 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 C1orf100Q5SVJ3 147 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 GLT8D1Q68CQ7 371 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 OR4K15Q8NH41 348 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 ETAA1Q9NY74 926 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 BLOC1S6Q9UL45 172 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 PEX16Q9Y5Y5 336 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A0A6YYD4 124 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 UBE2QL1A1L167 161 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 LEUTXA8MZ59 168 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 C12orf77C9JDV5 145 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC22A1O15245 554 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 MT-ND4P03905 459 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 HTR2CP28335 458 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 GABARAPL2P60520 117 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 QRFPP83859 136 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 KLHDC1Q8N7A1 406 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 CST11Q9H112 138 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 SPACA1Q9HBV2 294 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1W2PPI3 338 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 SHISA3A0PJX4 238 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM90A10PA6NDY2 464 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM90A18PA6NE21 464 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM90A16PA6NEW6 464 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM90A7PA6NKC0 464 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM90A12PA8MX19 464 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 MCRIP1C9JLW8 97 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 PDCD6O75340 191 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM90A15PP0C7V4 464 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM90A13PP0C7W8 464 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM90A14PP0C7W9 464 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM90A24PP0C7X0 464 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 CALRP27797 417 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 KIR2DS4P43632 304 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 LOXL3P58215 753 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 Q6ZPA2 131 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 GAPTQ8N292 157 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 C11orf44Q8N8P7 122 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 OR2T6Q8NHC8 308 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 TOMM40LQ969M1 308 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 ARL11Q969Q4 196 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 SULT4A1Q9BR01 284 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM59Q9BXS4 323 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 SERTAD4Q9NUC0 356 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM14DPA8MWL7 114 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC31A2O15432 143 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 TSPAN15O95858 294 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 CD37P11049 281 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 CHATP28329 748 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 PRRX1P54821 245 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 CLDN12P56749 244 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 BLCAPP62952 87 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 PRR18Q8N4B5 295 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 OR6M1Q8NGM8 313 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 OR1L1Q8NH94 360 aa14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.3 ms