RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 BPNT1O95861 308 aa16.92■□□□□ 0.3
ACTB-211ENST00000480301 GZMHP20718 246 aa16.92■□□□□ 0.3
ACTB-211ENST00000480301 NFYBP25208 207 aa16.92■□□□□ 0.3
ACTB-211ENST00000480301 PSMB9P28065 219 aa16.92■□□□□ 0.3
ACTB-211ENST00000480301 SSTR5P35346 364 aa16.92■□□□□ 0.3
ACTB-211ENST00000480301 RAB13P51153 203 aa16.92■□□□□ 0.3
ACTB-211ENST00000480301 PLA1AQ53H76 456 aa16.92■□□□□ 0.3
ACTB-211ENST00000480301 NDNFQ8TB73 568 aa16.92■□□□□ 0.3
ACTB-211ENST00000480301 CCDC107Q8WV48 283 aa16.92■□□□□ 0.3
ACTB-211ENST00000480301 ZNF747Q9BV97 191 aa16.92■□□□□ 0.3
ACTB-211ENST00000480301 TM2D1Q9BX74 207 aa16.92■□□□□ 0.3
ACTB-211ENST00000480301 TMEM59Q9BXS4 323 aa16.92■□□□□ 0.3
ACTB-211ENST00000480301 ETAA1Q9NY74 926 aa16.92■□□□□ 0.3
ACTB-211ENST00000480301 HILPDAQ9Y5L2 63 aa16.92■□□□□ 0.3
ACTB-211ENST00000480301 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa16.91■□□□□ 0.3
ACTB-211ENST00000480301 C15orf65H3BRN8 121 aa16.91■□□□□ 0.3
ACTB-211ENST00000480301 PDCD6O75340 191 aa16.91■□□□□ 0.3
ACTB-211ENST00000480301 HTR1DP28221 377 aa16.91■□□□□ 0.3
ACTB-211ENST00000480301 P2RY14Q15391 338 aa16.91■□□□□ 0.3
ACTB-211ENST00000480301 FAM189A2Q15884 450 aa16.91■□□□□ 0.3
ACTB-211ENST00000480301 HLA-DRB5Q30154 266 aa16.91■□□□□ 0.3
ACTB-211ENST00000480301 KCTD21Q4G0X4 260 aa16.91■□□□□ 0.3
ACTB-211ENST00000480301 Q6ZSV7 163 aa16.91■□□□□ 0.3
ACTB-211ENST00000480301 OR10A7Q8NGE5 316 aa16.91■□□□□ 0.3
ACTB-211ENST00000480301 OR4F5Q8NH21 305 aa16.91■□□□□ 0.3
ACTB-211ENST00000480301 ZNF596Q8TC21 504 aa16.91■□□□□ 0.3
ACTB-211ENST00000480301 PLGRKTQ9HBL7 147 aa16.91■□□□□ 0.3
ACTB-211ENST00000480301 DPM3Q9P2X0 92 aa16.91■□□□□ 0.3
ACTB-211ENST00000480301 V9GY05 133 aa16.91■□□□□ 0.3
ACTB-211ENST00000480301 UBE2QL1A1L167 161 aa16.9■□□□□ 0.3
ACTB-211ENST00000480301 POM121CA8CG34 1229 aa16.9■□□□□ 0.3
ACTB-211ENST00000480301 H3BUI4 141 aa16.9■□□□□ 0.3
ACTB-211ENST00000480301 AIPO00170 330 aa16.9■□□□□ 0.3
ACTB-211ENST00000480301 TOR1AO14656 332 aa16.9■□□□□ 0.3
ACTB-211ENST00000480301 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
ACTB-211ENST00000480301 GALP22466 123 aa16.9■□□□□ 0.3
ACTB-211ENST00000480301 DYNLT3P51808 116 aa16.9■□□□□ 0.3
ACTB-211ENST00000480301 LTC4SQ16873 150 aa16.9■□□□□ 0.3
ACTB-211ENST00000480301 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
ACTB-211ENST00000480301 NICN1Q9BSH3 213 aa16.9■□□□□ 0.3
ACTB-211ENST00000480301 BEX1Q9HBH7 125 aa16.9■□□□□ 0.3
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ACTB-211ENST00000480301 A0A1B0GUS0 222 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 CA11O75493 328 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 ARSBP15848 533 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 CHATP28329 748 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 PSMD7P51665 324 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 PRRX1P54821 245 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 RAB11BQ15907 218 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 NKAPLQ5M9Q1 402 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 OR2W3Q7Z3T1 314 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 OR4K15Q8NH41 348 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 OR9G1Q8NH87 305 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 LINC01006Q8NI28 216 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 LEAP2Q969E1 77 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 ARL11Q969Q4 196 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 LPAR5Q9H1C0 372 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 PSG11Q9UQ72 335 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 CLPSL1A2RUU4 121 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 LEUTXA8MZ59 168 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 LY6LH3BQJ8 138 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 HAX1O00165 279 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 PDCD5O14737 125 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 ORC5O43913 435 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 TSPAN9O75954 239 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 IGHV3-7P01780 117 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 CLDN12P56749 244 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 C22orf42Q6IC83 251 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 OR51D1Q8NGF3 324 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 UBALD1Q8TB05 177 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 FAM3DQ96BQ1 224 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 NEDD4LQ96PU5 975 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 SULT4A1Q9BR01 284 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 MMP28Q9H239 520 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 C16orf95Q9H693 158 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 ABCB10Q9NRK6 738 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 TCF19Q9Y242 345 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 A6NDX4 124 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 C12orf77C9JDV5 145 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 J3QR06 171 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 LDLRAD4O15165 306 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 OR10A3P58181 314 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 C2orf76Q3KRA6 126 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 HES5Q5TA89 166 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 OLFML2AQ68BL7 652 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 LIAT1Q6ZQX7 453 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 C6orf201Q7Z4U5 140 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 FAM89BQ8N5H3 189 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 CREB3L1Q96BA8 519 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 FAAP24Q9BTP7 215 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 FBLN5Q9UBX5 448 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 STEAP1Q9UHE8 339 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 STUB1Q9UNE7 303 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 F2RL2O00254 374 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-211ENST00000480301 CHST1O43916 411 aa16.86■□□□□ 0.29
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