RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449757.5

DDX39B-211, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-211ENST00000449757 NEK7Q8TDX7 302 aa8.05□□□□□ -1.12
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DDX39B-211ENST00000449757 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
DDX39B-211ENST00000449757 C4orf36Q96KX1 117 aa8.05□□□□□ -1.12
DDX39B-211ENST00000449757 KCTD7Q96MP8 289 aa8.05□□□□□ -1.12
DDX39B-211ENST00000449757 S1PR3Q99500 378 aa8.05□□□□□ -1.12
DDX39B-211ENST00000449757 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
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DDX39B-211ENST00000449757 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa8.04□□□□□ -1.12
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DDX39B-211ENST00000449757 OR10A7Q8NGE5 316 aa8.04□□□□□ -1.12
DDX39B-211ENST00000449757 OR5D14Q8NGL3 314 aa8.04□□□□□ -1.12
DDX39B-211ENST00000449757 OR1N2Q8NGR9 330 aa8.04□□□□□ -1.12
DDX39B-211ENST00000449757 CCDC107Q8WV48 283 aa8.04□□□□□ -1.12
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DDX39B-211ENST00000449757 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP8.03□□□□□ -1.123e-6■□□□□ 10.7
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DDX39B-211ENST00000449757 LINC00311Q8N616 119 aa8.02□□□□□ -1.13
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DDX39B-211ENST00000449757 DCUN1D4Q92564 292 aa8.02□□□□□ -1.13
DDX39B-211ENST00000449757 S100A13Q99584 98 aa8.02□□□□□ -1.13
DDX39B-211ENST00000449757 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa8.02□□□□□ -1.13
DDX39B-211ENST00000449757 ALG8Q9BVK2 526 aa8.02□□□□□ -1.13
DDX39B-211ENST00000449757 TAS2R4Q9NYW5 299 aa8.02□□□□□ -1.13
DDX39B-211ENST00000449757 GNG12Q9UBI6 72 aa8.02□□□□□ -1.13
DDX39B-211ENST00000449757 ING4Q9UNL4 249 aa8.02□□□□□ -1.13
DDX39B-211ENST00000449757 ST3GAL6Q9Y274 331 aa8.02□□□□□ -1.13
DDX39B-211ENST00000449757 VSIG4Q9Y279 399 aa8.02□□□□□ -1.13
DDX39B-211ENST00000449757 CSMD3Q7Z407 3707 aa8.01□□□□□ -1.13
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM212A6NML5 194 aa8.01□□□□□ -1.13
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