RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 COMMD1Q8N668 190 aa16.61■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 LINC00482Q8N8I6 264 aa16.61■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 OR51D1Q8NGF3 324 aa16.61■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 S100A13Q99584 98 aa16.61■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 GPR61Q9BZJ8 451 aa16.61■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF581Q9P0T4 197 aa16.61■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 ING4Q9UNL4 249 aa16.61■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa16.6■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 ORC5O43913 435 aa16.6■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 IGKV1D-33P01593 117 aa16.6■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 IGKV1-33P01594 117 aa16.6■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa16.6■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 RIPK1Q13546 671 aa16.6■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 ETV3LQ6ZN32 361 aa16.6■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 IZUMO1Q8IYV9 350 aa16.6■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 ZFP57Q9NU63 452 aa16.6■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa16.59■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 GTF2F2P13984 249 aa16.59■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 MYL12AP19105 171 aa16.59■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 FSTP19883 344 aa16.59■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 SERPINA2P20848 420 aa16.59■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 GPR176Q14439 515 aa16.59■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 YIF1BQ5BJH7 314 aa16.59■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF497Q6ZNH5 498 aa16.59■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF329Q86UD4 541 aa16.59■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 SPACA1Q9HBV2 294 aa16.59■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
LIMS1-208ENST00000428064 TRAV39A0A0B4J263 110 aa16.58■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 K7EIL1 84 aa16.58■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 CCRL2O00421 344 aa16.58■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 MPIG6BO95866 241 aa16.58■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 LALBAP00709 142 aa16.58■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 THBS3P49746 956 aa16.58■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM30BQ3MIR4 351 aa16.58■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 Q499Y3 187 aa16.58■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 SLC35E3Q7Z769 313 aa16.58■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa16.58■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 FOXRED2Q8IWF2 684 aa16.58■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 Q8N6K4 173 aa16.58■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 GHSRQ92847 366 aa16.58■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 ARL11Q969Q4 196 aa16.58■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 GFOD1Q9NXC2 390 aa16.58■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 CKLFQ9UBR5 152 aa16.58■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 SERPINE3A8MV23 424 aa16.57■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP16.57■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 SLC35B1P78383 322 aa16.57■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 MED21Q13503 144 aa16.57■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 OR2W3Q7Z3T1 314 aa16.57■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 CDH26Q8IXH8 852 aa16.57■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF485Q8NCK3 441 aa16.57■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa16.57■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 PGLYRP3Q96LB9 341 aa16.57■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 RAB9BQ9NP90 201 aa16.57■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PPE3 182 aa16.56■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 MT-ND4P03905 459 aa16.56■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 IL3RAP26951 378 aa16.56■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF137PP52743 207 aa16.56■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 HNF4GQ14541 408 aa16.56■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 SLC22A6Q4U2R8 563 aa16.56■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 ATAD3CQ5T2N8 411 aa16.56■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 TTC23Q5W5X9 447 aa16.56■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 GAPTQ8N292 157 aa16.56■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 STPG2Q8N412 459 aa16.56■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM104Q8NE00 496 aa16.56■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 OR13C5Q8NGS8 318 aa16.56■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 OR2T10Q8NGZ9 312 aa16.56■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 ORAI1Q96D31 301 aa16.56■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM80Q96HE8 168 aa16.56■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 ABCG5Q9H222 651 aa16.56■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 C8orf4Q9NR00 106 aa16.56■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PP11 408 aa16.55■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 AIPO00170 330 aa16.55■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 EBAG9O00559 213 aa16.55■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 TXNL1O43396 289 aa16.55■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 CD1BP29016 333 aa16.55■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 KRTAP10-11P60412 298 aa16.55■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 MOB3BQ86TA1 216 aa16.55■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 STX19Q8N4C7 294 aa16.55■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 SETD9Q8NE22 299 aa16.55■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 DPF1Q92782 380 aa16.55■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 CLEC2DQ9UHP7 191 aa16.55■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa16.54■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa16.54■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 MAGEA13PA6NCF6 341 aa16.54■□□□□ 0.24
LIMS1-208ENST00000428064 AP4M1O00189 453 aa16.54■□□□□ 0.24
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