RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416295.1

SEMA3B-201, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 1,088 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-201ENST00000416295 KCNK15Q9H427 330 aa14.61□□□□□ -0.07
SEMA3B-201ENST00000416295 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SEMA3B-201ENST00000416295 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa14.61□□□□□ -0.07
SEMA3B-201ENST00000416295 STEAP1Q9UHE8 339 aa14.61□□□□□ -0.07
SEMA3B-201ENST00000416295 FAM181BA6NEQ2 426 aa14.6□□□□□ -0.07
SEMA3B-201ENST00000416295 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa14.6□□□□□ -0.07
SEMA3B-201ENST00000416295 GPR137BO60478 399 aa14.6□□□□□ -0.07
SEMA3B-201ENST00000416295 RAB3BP20337 219 aa14.6□□□□□ -0.07
SEMA3B-201ENST00000416295 NFYBP25208 207 aa14.6□□□□□ -0.07
SEMA3B-201ENST00000416295 CFPP27918 469 aa14.6□□□□□ -0.07
SEMA3B-201ENST00000416295 CHATP28329 748 aa14.6□□□□□ -0.07
SEMA3B-201ENST00000416295 GDNFP39905 211 aa14.6□□□□□ -0.07
SEMA3B-201ENST00000416295 FOXL1Q12952 345 aa14.6□□□□□ -0.07
SEMA3B-201ENST00000416295 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa14.6□□□□□ -0.07
SEMA3B-201ENST00000416295 GAPTQ8N292 157 aa14.6□□□□□ -0.07
SEMA3B-201ENST00000416295 NDNFQ8TB73 568 aa14.6□□□□□ -0.07
SEMA3B-201ENST00000416295 FAM3DQ96BQ1 224 aa14.6□□□□□ -0.07
SEMA3B-201ENST00000416295 SSX3Q99909 188 aa14.6□□□□□ -0.07
SEMA3B-201ENST00000416295 ZNF696Q9H7X3 374 aa14.6□□□□□ -0.07
SEMA3B-201ENST00000416295 RAB9BQ9NP90 201 aa14.6□□□□□ -0.07
SEMA3B-201ENST00000416295 FBLN5Q9UBX5 448 aa14.6□□□□□ -0.07
SEMA3B-201ENST00000416295 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa14.6□□□□□ -0.07
SEMA3B-201ENST00000416295 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa14.6□□□□□ -0.07
SEMA3B-201ENST00000416295 TRAV39A0A0B4J263 110 aa14.59□□□□□ -0.07
SEMA3B-201ENST00000416295 SHISA3A0PJX4 238 aa14.59□□□□□ -0.07
SEMA3B-201ENST00000416295 IFITM5A6NNB3 132 aa14.59□□□□□ -0.07
SEMA3B-201ENST00000416295 TOR1AO14656 332 aa14.59□□□□□ -0.07
SEMA3B-201ENST00000416295 ORC5O43913 435 aa14.59□□□□□ -0.07
SEMA3B-201ENST00000416295 HTR1DP28221 377 aa14.59□□□□□ -0.07
SEMA3B-201ENST00000416295 SSTR5P35346 364 aa14.59□□□□□ -0.07
SEMA3B-201ENST00000416295 PRRX1P54821 245 aa14.59□□□□□ -0.07
SEMA3B-201ENST00000416295 OR10A3P58181 314 aa14.59□□□□□ -0.07
SEMA3B-201ENST00000416295 NKAPLQ5M9Q1 402 aa14.59□□□□□ -0.07
SEMA3B-201ENST00000416295 C6orf183Q5T699 404 aa14.59□□□□□ -0.07
SEMA3B-201ENST00000416295 HES5Q5TA89 166 aa14.59□□□□□ -0.07
SEMA3B-201ENST00000416295 TRAT1Q6PIZ9 186 aa14.59□□□□□ -0.07
SEMA3B-201ENST00000416295 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa14.59□□□□□ -0.07
SEMA3B-201ENST00000416295 OR51D1Q8NGF3 324 aa14.59□□□□□ -0.07
SEMA3B-201ENST00000416295 OR4P4Q8NGL7 312 aa14.59□□□□□ -0.07
SEMA3B-201ENST00000416295 CCDC107Q8WV48 283 aa14.59□□□□□ -0.07
SEMA3B-201ENST00000416295 CREB3L1Q96BA8 519 aa14.59□□□□□ -0.07
SEMA3B-201ENST00000416295 ZNF286AQ9HBT8 521 aa14.59□□□□□ -0.07
SEMA3B-201ENST00000416295 UBE2QL1A1L167 161 aa14.58□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 FAM172BPA6NC97 362 aa14.58□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 VGLL3A8MV65 326 aa14.58□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 H3BUX3 64 aa14.58□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 IGLV1-47P01700 117 aa14.58□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 CD36P16671 472 aa14.58□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 CLDN12P56749 244 aa14.58□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 SSX2Q16385 188 aa14.58□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa14.58□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 TPRA1Q86W33 373 aa14.58□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 OR9G1Q8NH87 305 aa14.58□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 RFESDQ8TAC1 157 aa14.58□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 ARL11Q969Q4 196 aa14.58□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 KCTD7Q96MP8 289 aa14.58□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 NICN1Q9BSH3 213 aa14.58□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 LPAR5Q9H1C0 372 aa14.58□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 OR51E2Q9H255 320 aa14.58□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 ABCB10Q9NRK6 738 aa14.58□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 DPM3Q9P2X0 92 aa14.58□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 C15orf65H3BRN8 121 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 SPINT2O43291 252 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 CEACAM3P40198 252 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 FAM189A2Q15884 450 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 LTC4SQ16873 150 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 HLA-DRB5Q30154 266 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 C2orf76Q3KRA6 126 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 TMEM30BQ3MIR4 351 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 AWAT1Q58HT5 328 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 ZNF554Q86TJ5 538 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 FAM89BQ8N5H3 189 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 OR52M1Q8NGK5 317 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 OR4K15Q8NH41 348 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 SULT4A1Q9BR01 284 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 A0A0A6YYD4 124 aa14.56□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa14.56□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 LEUTXA8MZ59 168 aa14.56□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 LDLRAD4O15165 306 aa14.56□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 NDUFA7O95182 113 aa14.56□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 GADD45AP24522 165 aa14.56□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 PAX6P26367 422 aa14.56□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 DYNLT3P51808 116 aa14.56□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 ARHGDIBP52566 201 aa14.56□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 LIAT1Q6ZQX7 453 aa14.56□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 C6orf201Q7Z4U5 140 aa14.56□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 DYNAPQ8N1N2 210 aa14.56□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 OR56B1Q8NGI3 324 aa14.56□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 OR4F5Q8NH21 305 aa14.56□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 LIN7BQ9HAP6 207 aa14.56□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 RAB18Q9NP72 206 aa14.56□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SEMA3B-201ENST00000416295 C1RLQ9NZP8 487 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.6 ms