RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM14DPA8MWL7 114 aa12.04□□□□□ -0.48
CSAG1-201ENST00000361211 FAM90A12PA8MX19 464 aa12.04□□□□□ -0.48
CSAG1-201ENST00000361211 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa12.04□□□□□ -0.48
CSAG1-201ENST00000361211 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa12.04□□□□□ -0.48
CSAG1-201ENST00000361211 MCRIP1C9JLW8 97 aa12.04□□□□□ -0.48
CSAG1-201ENST00000361211 C15orf65H3BRN8 121 aa12.04□□□□□ -0.48
CSAG1-201ENST00000361211 AIPO00170 330 aa12.04□□□□□ -0.48
CSAG1-201ENST00000361211 MT-ND4P03905 459 aa12.04□□□□□ -0.48
CSAG1-201ENST00000361211 FAM90A15PP0C7V4 464 aa12.04□□□□□ -0.48
CSAG1-201ENST00000361211 FAM90A13PP0C7W8 464 aa12.04□□□□□ -0.48
CSAG1-201ENST00000361211 FAM90A14PP0C7W9 464 aa12.04□□□□□ -0.48
CSAG1-201ENST00000361211 FAM90A24PP0C7X0 464 aa12.04□□□□□ -0.48
CSAG1-201ENST00000361211 UBBP0CG47 229 aa12.04□□□□□ -0.48
CSAG1-201ENST00000361211 PSMB9P28065 219 aa12.04□□□□□ -0.48
CSAG1-201ENST00000361211 HTR1DP28221 377 aa12.04□□□□□ -0.48
CSAG1-201ENST00000361211 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
CSAG1-201ENST00000361211 HLA-DRB5Q30154 266 aa12.04□□□□□ -0.48
CSAG1-201ENST00000361211 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF773Q6PK81 442 aa12.04□□□□□ -0.48
CSAG1-201ENST00000361211 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa12.04□□□□□ -0.48
CSAG1-201ENST00000361211 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
CSAG1-201ENST00000361211 LINC01006Q8NI28 216 aa12.04□□□□□ -0.48
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM59Q9BXS4 323 aa12.04□□□□□ -0.48
CSAG1-201ENST00000361211 UBE2QL1A1L167 161 aa12.03□□□□□ -0.48
CSAG1-201ENST00000361211 CLPSL1A2RUU4 121 aa12.03□□□□□ -0.48
CSAG1-201ENST00000361211 CCRL2O00421 344 aa12.03□□□□□ -0.48
CSAG1-201ENST00000361211 SLC17A2O00624 439 aa12.03□□□□□ -0.48
CSAG1-201ENST00000361211 PDCD6O75340 191 aa12.03□□□□□ -0.48
CSAG1-201ENST00000361211 BPNT1O95861 308 aa12.03□□□□□ -0.48
CSAG1-201ENST00000361211 FUT3P21217 361 aa12.03□□□□□ -0.48
CSAG1-201ENST00000361211 CLDN12P56749 244 aa12.03□□□□□ -0.48
CSAG1-201ENST00000361211 FBLN7Q53RD9 439 aa12.03□□□□□ -0.48
CSAG1-201ENST00000361211 NKAPLQ5M9Q1 402 aa12.03□□□□□ -0.48
CSAG1-201ENST00000361211 OLFML2AQ68BL7 652 aa12.03□□□□□ -0.48
CSAG1-201ENST00000361211 GAPTQ8N292 157 aa12.03□□□□□ -0.48
CSAG1-201ENST00000361211 OR4K15Q8NH41 348 aa12.03□□□□□ -0.48
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF596Q8TC21 504 aa12.03□□□□□ -0.48
CSAG1-201ENST00000361211 TM2D1Q9BX74 207 aa12.03□□□□□ -0.48
CSAG1-201ENST00000361211 BEX1Q9HBH7 125 aa12.03□□□□□ -0.48
CSAG1-201ENST00000361211 PLGRKTQ9HBL7 147 aa12.03□□□□□ -0.48
CSAG1-201ENST00000361211 ABCB10Q9NRK6 738 aa12.03□□□□□ -0.48
CSAG1-201ENST00000361211 DPM3Q9P2X0 92 aa12.03□□□□□ -0.48
CSAG1-201ENST00000361211 TCF19Q9Y242 345 aa12.03□□□□□ -0.48
CSAG1-201ENST00000361211 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa12.02□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa12.02□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 TOR1AO14656 332 aa12.02□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 CHATP28329 748 aa12.02□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 GNG10P50151 68 aa12.02□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 OR10A3P58181 314 aa12.02□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 KRTAP10-3P60369 221 aa12.02□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 RAB11BQ15907 218 aa12.02□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 C5orf24Q7Z6I8 188 aa12.02□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM219Q86XT9 240 aa12.02□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 OR51D1Q8NGF3 324 aa12.02□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 OR9G1Q8NH87 305 aa12.02□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 KCNG3Q8TAE7 436 aa12.02□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 WFDC12Q8WWY7 111 aa12.02□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 ARL11Q969Q4 196 aa12.02□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 SULT4A1Q9BR01 284 aa12.02□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 LPAR5Q9H1C0 372 aa12.02□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 MMP28Q9H239 520 aa12.02□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 PSG11Q9UQ72 335 aa12.02□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa12.01□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 A0A1B0GUS0 222 aa12.01□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 A0A1W2PPE3 182 aa12.01□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 A6NDX4 124 aa12.01□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 POM121CA8CG34 1229 aa12.01□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 C12orf77C9JDV5 145 aa12.01□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 LY6LH3BQJ8 138 aa12.01□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 J3QR06 171 aa12.01□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 TSPAN9O75954 239 aa12.01□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 IGHV3-43DP0DP04 118 aa12.01□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 ARSBP15848 533 aa12.01□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 DYNLT3P51808 116 aa12.01□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 PLA2G7Q13093 441 aa12.01□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 KCTD21Q4G0X4 260 aa12.01□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa12.01□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 HES5Q5TA89 166 aa12.01□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 C22orf42Q6IC83 251 aa12.01□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 C6orf201Q7Z4U5 140 aa12.01□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 OR10A7Q8NGE5 316 aa12.01□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 FCGR1BQ92637 280 aa12.01□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 C16orf95Q9H693 158 aa12.01□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa12.01□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 SIGLEC9Q9Y336 463 aa12.01□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 RNF114Q9Y508 228 aa12.01□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 V9GY05 133 aa12.01□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 FBN3Q75N90 2809 aa12.01□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa12□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 LEUTXA8MZ59 168 aa12□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 F2RL2O00254 374 aa12□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 ORC5O43913 435 aa12□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 GLAP06280 429 aa12□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 GZMHP20718 246 aa12□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 CD24P25063 80 aa12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms