RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288022.1

PDF-201, Transcript of peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDF, Length 1,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDF-201ENST00000288022 MT-ND4P03905 459 aa20.34■□□□□ 0.85
PDF-201ENST00000288022 MYL9P24844 172 aa20.34■□□□□ 0.85
PDF-201ENST00000288022 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PDF-201ENST00000288022 RELBQ01201 579 aa20.34■□□□□ 0.85
PDF-201ENST00000288022 OR4P4Q8NGL7 312 aa20.34■□□□□ 0.85
PDF-201ENST00000288022 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa20.34■□□□□ 0.85
PDF-201ENST00000288022 V9GY05 133 aa20.34■□□□□ 0.85
PDF-201ENST00000288022 PDCD5O14737 125 aa20.33■□□□□ 0.85
PDF-201ENST00000288022 NDUFA7O95182 113 aa20.33■□□□□ 0.85
PDF-201ENST00000288022 ARSBP15848 533 aa20.33■□□□□ 0.85
PDF-201ENST00000288022 GZMHP20718 246 aa20.33■□□□□ 0.85
PDF-201ENST00000288022 CD34P28906 385 aa20.33■□□□□ 0.85
PDF-201ENST00000288022 PSMD7P51665 324 aa20.33■□□□□ 0.85
PDF-201ENST00000288022 PRRX1P54821 245 aa20.33■□□□□ 0.85
PDF-201ENST00000288022 UNC119Q13432 240 aa20.33■□□□□ 0.85
PDF-201ENST00000288022 KCTD21Q4G0X4 260 aa20.33■□□□□ 0.85
PDF-201ENST00000288022 SIGIRRQ6IA17 410 aa20.33■□□□□ 0.85
PDF-201ENST00000288022 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa20.33■□□□□ 0.85
PDF-201ENST00000288022 NEDD4LQ96PU5 975 aa20.33■□□□□ 0.85
PDF-201ENST00000288022 BEX1Q9HBH7 125 aa20.33■□□□□ 0.85
PDF-201ENST00000288022 A0A087X0M5 115 aa20.32■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 A0A1B0GX30 115 aa20.32■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa20.32■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 IGHV3-7P01780 117 aa20.32■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 GLAP06280 429 aa20.32■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 RAB13P51153 203 aa20.32■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 UTF1Q5T230 341 aa20.32■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 C22orf42Q6IC83 251 aa20.32■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 OR4K15Q8NH41 348 aa20.32■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 OR9G1Q8NH87 305 aa20.32■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 LEAP2Q969E1 77 aa20.32■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 ARL11Q969Q4 196 aa20.32■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 LINC00574Q9H8X3 128 aa20.32■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 DPM3Q9P2X0 92 aa20.32■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 VGLL3A8MV65 326 aa20.31■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 TMEM14DPA8MWL7 114 aa20.31■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 CLDN12P56749 244 aa20.31■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 HLA-DRB5Q30154 266 aa20.31■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 OR10A7Q8NGE5 316 aa20.31■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 UBALD1Q8TB05 177 aa20.31■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 NICN1Q9BSH3 213 aa20.31■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa20.3■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 A0A1B0GUS0 222 aa20.3■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 LEUTXA8MZ59 168 aa20.3■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 IGLV1-47P01700 117 aa20.3■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 GALP22466 123 aa20.3■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 CEACAM3P40198 252 aa20.3■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 RANBP1P43487 201 aa20.3■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 QRFPP83859 136 aa20.3■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 NEDD8Q15843 81 aa20.3■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 HES5Q5TA89 166 aa20.3■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 OR2W3Q7Z3T1 314 aa20.3■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 OR51D1Q8NGF3 324 aa20.3■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 PIFOQ8TCI5 191 aa20.3■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 CREB3L1Q96BA8 519 aa20.3■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 TM2D1Q9BX74 207 aa20.3■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 MMP24Q9Y5R2 645 aa20.3■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 POM121CA8CG34 1229 aa20.29■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 F2RL2O00254 374 aa20.29■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 ORC5O43913 435 aa20.29■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 CA11O75493 328 aa20.29■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 CHATP28329 748 aa20.29■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 GNG10P50151 68 aa20.29■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 C6orf183Q5T699 404 aa20.29■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 FAM3DQ96BQ1 224 aa20.29■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 CYYR1Q96J86 154 aa20.29■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 ZNF747Q9BV97 191 aa20.29■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 MMP28Q9H239 520 aa20.29■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 RAB18Q9NP72 206 aa20.29■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 STUB1Q9UNE7 303 aa20.29■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 SHISA3A0PJX4 238 aa20.28■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 C15orf65H3BRN8 121 aa20.28■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa20.28■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 OR10A3P58181 314 aa20.28■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 LIAT1Q6ZQX7 453 aa20.28■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 Q6ZSV7 163 aa20.28■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 C6orf201Q7Z4U5 140 aa20.28■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 PRR18Q8N4B5 295 aa20.28■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 SULT4A1Q9BR01 284 aa20.28■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 FAAP24Q9BTP7 215 aa20.28■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 RAB9BQ9NP90 201 aa20.28■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 STEAP1Q9UHE8 339 aa20.28■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 SSR3Q9UNL2 185 aa20.28■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 PSG11Q9UQ72 335 aa20.28■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 CLPSL1A2RUU4 121 aa20.27■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 J3QR06 171 aa20.27■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 SPINT2O43291 252 aa20.27■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 RAB3BP20337 219 aa20.27■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 DYNLT3P51808 116 aa20.27■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 ARHGDIBP52566 201 aa20.27■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 C2orf76Q3KRA6 126 aa20.27■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 OLFML2AQ68BL7 652 aa20.27■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 TRAT1Q6PIZ9 186 aa20.27■□□□□ 0.84
PDF-201ENST00000288022 LPAR5Q9H1C0 372 aa20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms