RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550558.5

ASIC1-206, Transcript of acid sensing ion channel subunit 1, human

TSL 2

Gene ASIC1, Length 3,819 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ASIC1-206	ENST00000550558	SPRY3	O43610	288 aa		14.55	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	TFF1	P04155	84 aa		14.55	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	SP9	P0CG40	484 aa		14.55	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	SLC25A4	P12235	298 aa		14.55	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	CHAT	P28329	748 aa		14.55	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	GUK1	Q16774	197 aa		14.55	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	NABP1	Q96AH0	204 aa		14.55	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		14.55	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	14.55	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	COL6A3	P12111	3177 aa		14.55	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		14.55	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	RHBDL1	O75783	438 aa		14.55	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		14.55	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		14.55	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		14.55	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558		F8VVB4	439 aa		14.54	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558		F8VWA3	439 aa		14.54	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	SRPX	P78539	464 aa		14.54	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		14.54	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		14.54	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		14.54	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		14.54	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	14.54	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	LPAR6	P43657	344 aa		14.54	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	14.54	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		14.54	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	BIN3	Q9NQY0	253 aa		14.54	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		14.54	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	GPR137B	O60478	399 aa		14.54	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	IFNA10	P01566	189 aa		14.54	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	14.54	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	14.54	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		14.54	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	ZNF716	A6NP11	495 aa		14.53	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	14.53	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	IFNA4	P05014	189 aa		14.53	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	ZNF708	P17019	499 aa		14.53	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	H3F3A	P84243	136 aa		14.53	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	BAX	Q07812	192 aa		14.53	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	ASB13	Q8WXK3	278 aa		14.53	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	RNF126	Q9BV68	326 aa		14.53	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	KLK10	O43240	276 aa		14.53	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	ACTL6A	O96019	429 aa		14.53	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	RHEB	Q15382	184 aa		14.53	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	TP53RK	Q96S44	253 aa		14.53	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	GPR87	Q9BY21	358 aa		14.53	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		14.53	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	IGF2R	P11717	2491 aa		14.53	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	ATRX	P46100	2492 aa		14.53	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	CD8A	P01732	235 aa		14.53	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	CELA3B	P08861	270 aa		14.53	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	OR8B8	Q15620	311 aa		14.53	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	AVPI1	Q5T686	147 aa		14.53	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		14.53	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	NPBWR1	P48145	328 aa		14.52	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	AES	Q08117	197 aa		14.52	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	ZNF345	Q14585	488 aa		14.52	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	GGN	Q86UU5	652 aa		14.52	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	MMP26	Q9NRE1	261 aa		14.52	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	TMEM100	Q9NV29	134 aa		14.52	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		14.52	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	CYTIP	O60759	359 aa		14.52	□□□□□ -0.09
ASIC1-206	ENST00000550558	HEXA	P06865	529 aa		14.52	□□□□□ -0.09
ASIC1-206	ENST00000550558	PSG2	P11465	335 aa		14.52	□□□□□ -0.09
ASIC1-206	ENST00000550558	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		14.52	□□□□□ -0.09
ASIC1-206	ENST00000550558	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		14.52	□□□□□ -0.09
ASIC1-206	ENST00000550558	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		14.52	□□□□□ -0.09
ASIC1-206	ENST00000550558	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	14.52	□□□□□ -0.09
ASIC1-206	ENST00000550558	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		14.52	□□□□□ -0.09
ASIC1-206	ENST00000550558	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		14.52	□□□□□ -0.09
ASIC1-206	ENST00000550558	RD3L	P0DJH9	198 aa		14.52	□□□□□ -0.09
ASIC1-206	ENST00000550558	S100A2	P29034	98 aa		14.52	□□□□□ -0.09
ASIC1-206	ENST00000550558	DYNLT3	P51808	116 aa		14.52	□□□□□ -0.09
ASIC1-206	ENST00000550558	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	14.52	□□□□□ -0.09
ASIC1-206	ENST00000550558	CST9LP1	Q5W188	147 aa		14.52	□□□□□ -0.09
ASIC1-206	ENST00000550558	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		14.52	□□□□□ -0.09
ASIC1-206	ENST00000550558	ENY2	Q9NPA8	101 aa		14.52	□□□□□ -0.09
ASIC1-206	ENST00000550558	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		14.52	□□□□□ -0.09
ASIC1-206	ENST00000550558	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		14.51	□□□□□ -0.09
ASIC1-206	ENST00000550558	TRIM77	I1YAP6	450 aa		14.51	□□□□□ -0.09
ASIC1-206	ENST00000550558	PROK2	Q9HC23	129 aa		14.51	□□□□□ -0.09
ASIC1-206	ENST00000550558	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		14.51	□□□□□ -0.09
ASIC1-206	ENST00000550558	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		14.51	□□□□□ -0.09
ASIC1-206	ENST00000550558		V9GYS6	101 aa		14.51	□□□□□ -0.09
ASIC1-206	ENST00000550558	CREBBP	Q92793	2442 aa		14.51	□□□□□ -0.09
ASIC1-206	ENST00000550558	NEURL1	O76050	574 aa		14.51	□□□□□ -0.09
ASIC1-206	ENST00000550558	HKR1	P10072	659 aa		14.51	□□□□□ -0.09
ASIC1-206	ENST00000550558	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		14.51	□□□□□ -0.09
ASIC1-206	ENST00000550558	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
ASIC1-206	ENST00000550558	PSG11	Q9UQ72	335 aa		14.51	□□□□□ -0.09
ASIC1-206	ENST00000550558	DNPH1	O43598	174 aa		14.51	□□□□□ -0.09
ASIC1-206	ENST00000550558	QRFP	P83859	136 aa		14.51	□□□□□ -0.09
ASIC1-206	ENST00000550558	C4orf17	Q53FE4	359 aa		14.51	□□□□□ -0.09
ASIC1-206	ENST00000550558	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		14.51	□□□□□ -0.09
ASIC1-206	ENST00000550558	RFNG	Q9Y644	331 aa		14.51	□□□□□ -0.09
ASIC1-206	ENST00000550558	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		14.5	□□□□□ -0.09

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