RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532474.5

RCN1-208, Transcript of reticulocalbin 1, human

TSL 3

Gene RCN1, Length 714 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RCN1-208	ENST00000532474	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	CKLF	Q9UBR5	152 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	AASS	Q9UDR5	926 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474		M0QZK8	103 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	TOR1A	O14656	332 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	CALCB	P10092	127 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	MNDA	P41218	407 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	GLIPR1	P48060	266 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	TAS2R43	P59537	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	DEFA6	Q01524	100 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	AES	Q08117	197 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	RIPK1	Q13546	671 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	GPR176	Q14439	515 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	RSU1	Q15404	277 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	TM4SF20	Q53R12	229 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474		Q6P435	159 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	ASCL4	Q6XD76	172 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	LINC00596	Q86U02	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	SATL1	Q86VE3	508 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474		Q8NFD4	153 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	OR52N1	Q8NH53	320 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	THRSP	Q92748	146 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	RFT1	Q96AA3	541 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	SMIM19	Q96E16	107 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	COQ2	Q96H96	371 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	TMEM80	Q96HE8	168 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	SPACA5	Q96QH8	159 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	S100A13	Q99584	98 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	VCX	Q9H320	206 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	IFT22	Q9H7X7	185 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF702P	Q9H963	129 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	IL36G	Q9NZH8	169 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474		H0YJX3	145 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	GABRP	O00591	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	OGG1	O15527	345 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	KCNAB3	O43448	404 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	XPNPEP2	O43895	674 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	MMP23A	O75900	390 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	IGLV1-47	P01700	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	OPN1MW	P04001	364 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	FAM106CP	P0CH98	169 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	GTF2F2	P13984	249 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	GZMH	P20718	246 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	PAX6	P26367	422 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	ECI1	P42126	302 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	SOX2	P48431	317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	ETV1	P50549	477 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	RAB13	P51153	203 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	RCN1	Q15293	331 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474		Q499Y3	187 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	PLA1A	Q53H76	456 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	TMEM219	Q86XT9	240 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCN1-208	ENST00000532474	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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