RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 H3F3AP84243 136 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 HTD2P86397 168 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 TFF3Q07654 80 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 SPOCK1Q08629 439 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ZNF616Q08AN1 781 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 OR1P1Q8NH06 330 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 OR51F2Q8NH61 342 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 FAM57AQ8TBR7 257 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 CPT1CQ8TCG5 803 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 GPR119Q8TDV5 335 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ST8SIA1Q92185 356 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 CORO2AQ92828 525 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 FAM3DQ96BQ1 224 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 TXN2Q99757 166 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 CDH20Q9HBT6 801 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 CEP295Q9C0D2 2601 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 B9A039 149 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 HSD17B6O14756 317 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 YPEL1O60688 119 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 CA7P43166 264 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 SOX2P48431 317 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 BIDP55957 195 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 CLDN18P56856 261 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 FBXW4P57775 412 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 SLAQ13239 276 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 RAB32Q13637 225 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 PRSS8Q16651 343 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 FAM166AQ6J272 317 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ZNF836Q6ZNA1 936 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ZNF100Q8IYN0 542 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 C1orf87Q8N0U7 546 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 TMEM251Q8N6I4 163 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 YPEL2Q96QA6 119 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 OSGIN2Q9Y236 505 aa6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 DSPP15924 2871 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 PRRX1P54821 245 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 RAB11BQ15907 218 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 SPINK14Q6IE38 97 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 SLC25A26Q70HW3 274 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ZNF584Q8IVC4 421 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 POC1AQ8NBT0 407 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 MFSD8Q8NHS3 518 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 RNF128Q8TEB7 428 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 TMEM239Q8WW34 195 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 Q96M85 177 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 VPS25Q9BRG1 176 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 KCNK15Q9H427 330 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 OR6C3Q9NZP0 311 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 MGAQ8IWI9 3026 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 SLC17A2O00624 439 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 CSN2P05814 226 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 DBIP07108 87 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 GLRA1P23415 457 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 TIMP3P35625 211 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 CAMLGP49069 296 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 RND2P52198 227 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 CLDN15P56746 228 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 PLCXD2Q0VAA5 305 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 C4orf17Q53FE4 359 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 KDM8Q8N371 416 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 OR51A2Q8NGJ7 313 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 TMEM234Q8WY98 164 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 WDYHV1Q96HA8 205 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 C2orf50Q96LR7 162 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 CST9LQ9H4G1 147 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 SPRR3Q9UBC9 169 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 FBXL17Q9UF56 701 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 TENM4Q6N022 2769 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 A0A0A6YYH2 397 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 A6NJ64 397 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 PRR32B1ATL7 298 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 SCGNO76038 276 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 AHSA1O95433 338 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 SLC6A8P48029 635 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 PDLIM4P50479 330 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 PRKAG1P54619 331 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 SEM1Q6ZVN7 128 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 OR14L1PQ8NHC6 308 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 MCHR2Q969V1 340 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 BPIFA2Q96DR5 249 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 GPR35Q9HC97 309 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 FBXO34Q9NWN3 711 aa6.62□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 FRRS1LQ9P0K9 344 aa6.62□□□□□ -1.35
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