RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 TMEM241Q24JQ0 296 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 AADACL3Q5VUY0 350 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 CATSPERDQ86XM0 798 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 OR11H7Q8NGC8 314 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 FAM57AQ8TBR7 257 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 SLAMF6Q96DU3 332 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 DIRC2Q96SL1 478 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 MS4A5Q9H3V2 200 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 FRRS1LQ9P0K9 344 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa6.7□□□□□ -1.34
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USP54-210ENST00000466048 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
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USP54-210ENST00000466048 OR52B4Q8NGK2 314 aa6.7□□□□□ -1.34
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USP54-210ENST00000466048 NMES1Q9C002 83 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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USP54-210ENST00000466048 FSTP19883 344 aa6.7□□□□□ -1.34
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USP54-210ENST00000466048 OR4F5Q8NH21 305 aa6.7□□□□□ -1.34
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USP54-210ENST00000466048 OR4F4Q96R69 305 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 GHITMQ9H3K2 345 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 SH2D2AQ9NP31 389 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 SOX15O60248 233 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 SLC2A1P11166 492 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 INSL4Q14641 139 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 WDR38Q5JTN6 314 aa6.69□□□□□ -1.34
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USP54-210ENST00000466048 Q8IYB0 196 aa6.69□□□□□ -1.34
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USP54-210ENST00000466048 OR13G1Q8NGZ3 307 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 ABHD5Q8WTS1 349 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 RAB1CQ92928 201 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 MED29Q9NX70 200 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 KCNK7Q9Y2U2 307 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 A0A0G2JK05 382 aa6.69□□□□□ -1.34
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USP54-210ENST00000466048 AKR1C3P42330 323 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 GALR1P47211 349 aa6.69□□□□□ -1.34
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USP54-210ENST00000466048 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 ZNF92Q03936 586 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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USP54-210ENST00000466048 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 WBP1Q96G27 269 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 OR10C1Q96KK4 312 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 A0A096LPE4 126 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 A0A1W2PPZ6 126 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 SERPINE3A8MV23 424 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 M0R1X1 148 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 ACTL6BO94805 426 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 MBPP02686 304 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 CD200P41217 278 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 FAM27D1Q5T7N8 215 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 LCN15Q6UWW0 184 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 Q6ZN92 141 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 PLPP7Q8NBV4 271 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 CMTM2Q8TAZ6 248 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 SECTM1Q8WVN6 248 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 SMIM12Q96EX1 92 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 NRIP2Q9BQI9 281 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 HINT2Q9BX68 163 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 HES7Q9BYE0 225 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 SFT2D2O95562 160 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 CXCL3P19876 107 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 SELENOPP49908 381 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 MTCP1P56278 107 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 TAS2R45P59539 299 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 PAFAH1B2P68402 229 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 PMP22Q01453 160 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 MRGPRGQ86SM5 289 aa6.68□□□□□ -1.34
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