RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 MSMO1Q15800 293 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 FBXW9Q5XUX1 488 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 ZNF880Q6PDB4 577 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 Q6ZRG5 221 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 LYZL2Q7Z4W2 148 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 TUSC5Q8IXB3 177 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 C15orf54Q8N8G6 183 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 ZBTB34Q8NCN2 500 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 OR10Z1Q8NGY1 313 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 FGFBP3Q8TAT2 258 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 FAM216AQ8WUB2 273 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 SLAMF9Q96A28 289 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 RAB40CQ96S21 281 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 RTL8AQ9BWD3 113 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 TLNRD1Q9H1K6 362 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 BIN3Q9NQY0 253 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 CACFD1Q9UGQ2 172 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 RNF150Q9ULK6 438 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 SDK2Q58EX2 2172 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 PINLYPA6NC86 204 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 TMEM210A6NLX4 147 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 J3QT63 122 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 PITX3O75364 302 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 SCGB1D2O95969 90 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 PLATP00750 562 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 HBE1P02100 147 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 PATE4P0C8F1 98 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 SNCAP37840 140 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 RFC3P40938 356 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 LPAR6P43657 344 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 TAS2R30P59541 319 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 MZT1Q08AG7 82 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 GABRA6Q16445 453 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 TBC1D28Q2M2D7 210 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 PHLDA2Q53GA4 152 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 OR2A2Q6IF42 318 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 ATRAIDQ6UW56 229 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 CALHM1Q8IU99 346 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 FOXRED2Q8IWF2 684 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 FAM58AQ8N1B3 248 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 TMEM251Q8N6I4 163 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 SLC35G3Q8N808 338 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 MDS2Q8NDY4 140 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 BHLHE23Q8NDY6 225 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 OR1K1Q8NGR3 316 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 OR10J5Q8NHC4 309 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 NEK7Q8TDX7 302 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 CABLES2Q9BTV7 478 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 LIME1Q9H400 295 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 CALHM2Q9HA72 323 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 C19orf12Q9NSK7 152 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 COQ3Q9NZJ6 369 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 OR2W1Q9Y3N9 320 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 MMP24Q9Y5R2 645 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 MYO7BQ6PIF6 2116 aa7.28□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 DMXL1Q9Y485 3027 aa7.28□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 FAM90A26D6RGX4 464 aa7.28□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 WRBO00258 174 aa7.28□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 NDUFA2O43678 99 aa7.28□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 PRH1P02810 166 aa7.28□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 IFNA4P05014 189 aa7.28□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 SFTA3P0C7M3 94 aa7.28□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 OR8U8P0C7N1 319 aa7.28□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 RAC2P15153 192 aa7.28□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 BCL3P20749 454 aa7.28□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 F2RP25116 425 aa7.28□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 MAGEA5P43359 124 aa7.28□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 NPBWR2P48146 333 aa7.28□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 MEOX1P50221 254 aa7.28□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 GPM6AP51674 278 aa7.28□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 UCNP55089 124 aa7.28□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 TLE4Q04727 773 aa7.28□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 RHEBQ15382 184 aa7.28□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 SP6Q3SY56 376 aa7.28□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 SPIN3Q5JUX0 258 aa7.28□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 AVPI1Q5T686 147 aa7.28□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 TBC1D26Q86UD7 250 aa7.28□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 DMBX1Q8NFW5 382 aa7.28□□□□□ -1.24
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