RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441703.5

HDAC6-210, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC6, Length 599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-210ENST00000441703 LYZL6O75951 148 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 TSPAN15O95858 294 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 ABHD16AO95870 558 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 PNPP00491 289 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 GCGP01275 180 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 PMP2P02689 132 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 DBIP07108 87 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 SFTPBP07988 381 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 SEC11BP0C7V7 166 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 OR8G3PP0DMU2 310 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 RPS2P15880 293 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF17P17021 662 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 RAB6AP20340 208 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 CXCR1P25024 350 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 CHATP28329 748 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 AKR1C3P42330 323 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF83P51522 516 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 CCR4P51679 360 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 EFNB2P52799 333 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 SLC25A1P53007 311 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 PRKAG1P54619 331 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 RPS23P62266 143 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 SPOCK1Q08629 439 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 MGAT2Q10469 447 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 PLA2G7Q13093 441 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 FHL1Q13642 323 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 OR8G1Q15617 311 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 AKIRIN2Q53H80 203 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 ACTBL2Q562R1 376 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 KHDC3LQ587J8 217 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 CDPF1Q6NVV7 123 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 BRICD5Q6PL45 260 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF836Q6ZNA1 936 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 SLC16A9Q7RTY1 509 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 FAM220AQ7Z4H9 259 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 GPR137CQ8N3F9 429 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 PRSS35Q8N3Z0 413 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 CYB561A3Q8NBI2 242 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 NPEPL1Q8NDH3 523 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 CCDC54Q8NEL0 328 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 OR9K2Q8NGE7 335 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 OR51D1Q8NGF3 324 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 OR52E2Q8NGJ4 325 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 OR13C2Q8NGS9 318 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 OR8S1Q8NH09 359 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 OR51F2Q8NH61 342 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 OR10D3Q8NH80 312 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 OR10J5Q8NHC4 309 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 PFN4Q8NHR9 129 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 ST7LQ8TDW4 575 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 ADAMTS15Q8TE58 950 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 ISOC2Q96AB3 205 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 ADGRG7Q96K78 797 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 SCGB3A2Q96PL1 93 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 ADOQ96SZ5 270 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF350Q9GZX5 532 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 CST11Q9H112 138 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 FKRPQ9H9S5 495 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 CES1P1Q9UKY3 287 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 A0A1W2PPE2 198 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 SMCO3A2RU48 225 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 UMAD1C9J7I0 102 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 M0QYG6 137 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 M0R143 59 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 DLEU1O43261 78 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 HIST1H2BKO60814 126 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 NDUFB2O95178 105 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 SFT2D2O95562 160 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 GPANK1O95872 356 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 KNG1P01042 644 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 ARG1P05089 322 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 HIST1H2BJP06899 126 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 MSMBP08118 114 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 GUSBP08236 651 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 HIST1H2BOP23527 126 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 PRTN3P24158 256 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 CD40P25942 277 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 IL12BP29460 328 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 HIST1H2BBP33778 126 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 THBS4P35443 961 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 EMDP50402 254 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF84P51523 738 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 HIST1H2BDP58876 126 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 HIST1H2BCP62807 126 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 DLK1P80370 383 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 EGR3Q06889 387 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 HAGHQ16775 308 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC6-210ENST00000441703 HIST2H2BEQ16778 126 aa5.49□□□□□ -1.53
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