RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 ETV6P41212 452 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 SCN1BQ07699 218 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 MADCAM1Q13477 382 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 PDCD1Q15116 288 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 MICBQ29980 383 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 MOGAT2Q3SYC2 334 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 C16orf87Q6PH81 154 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 C9orf139Q6ZV77 190 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 CHST4Q8NCG5 386 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 OR5T2Q8NGG2 359 aa10.26□□□□□ -0.77
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PRAME-208ENST00000438888 TSC22D3Q99576 134 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 PCGF1Q9BSM1 259 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 IFT22Q9H7X7 185 aa10.26□□□□□ -0.77
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PRAME-208ENST00000438888 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
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PRAME-208ENST00000438888 TRAV18A0A075B6X5 111 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa10.25□□□□□ -0.77
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PRAME-208ENST00000438888 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 C22orf46C9J442 243 aa10.25□□□□□ -0.77
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PRAME-208ENST00000438888 FUT3P21217 361 aa10.25□□□□□ -0.77
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PRAME-208ENST00000438888 Q6P435 159 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 FAM131AQ6UXB0 335 aa10.25□□□□□ -0.77
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PRAME-208ENST00000438888 ANGPTL6Q8NI99 470 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 AKIP1Q9NQ31 210 aa10.25□□□□□ -0.77
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PRAME-208ENST00000438888 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 V9GYH0 126 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 NKX6-3A6NJ46 265 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 SIRPB1O00241 398 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 GYPAP02724 150 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 CRYBA1P05813 215 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP10.24□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 PRDX2P32119 198 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 GABRA2P47869 451 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 RAG2P55895 527 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 PITPNAQ00169 270 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 ARL6IP1Q15041 203 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 PYHIN1Q6K0P9 492 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 C17orf107Q6ZR85 190 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 CD177Q8N6Q3 437 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 C15orf40Q8WUR7 153 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 WFDC12Q8WWY7 111 aa10.24□□□□□ -0.77
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PRAME-208ENST00000438888 PECRQ9BY49 303 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 ZNF222Q9UK12 451 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 TRAV24A0A0B4J272 114 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 SERPINE3A8MV23 424 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 MCRIP1C9JLW8 97 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 MFNGO00587 321 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 HSPB6O14558 160 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 ENSAO43768 121 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 HLA-DQB1P01920 261 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 TFF1P04155 84 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 GLAP06280 429 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 GNB3P16520 340 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 LMO1P25800 156 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 TMEM50BP56557 158 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 COL10A1Q03692 680 aa10.23□□□□□ -0.77
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