RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387446.1

RNU6ATAC4P-201, Transcript of RNA, U6atac small nuclear 4, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6ATAC4P, Length 126 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 IL5RAQ01344 420 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 ZNF45Q02386 682 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 NHLH2Q02577 135 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 CFHR3Q02985 330 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 ROM1Q03395 351 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 HSF2Q03933 536 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 ZNF90Q03938 601 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 PLP2Q04941 152 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 SLC34A1Q06495 639 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 PAX8Q06710 450 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 EGR3Q06889 387 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 PUDPQ08623 228 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 SCRN3Q0VDG4 424 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 TSPAN31Q12999 210 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 PDZK1IP1Q13113 114 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 BAMBIQ13145 260 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 FADDQ13158 208 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 PRDX4Q13162 271 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 IKZF1Q13422 519 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 FOXE3Q13461 319 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 ASAH1Q13510 395 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 GPR50Q13585 617 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 OR2F1Q13607 317 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 TPBGQ13641 420 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 PMS2P11Q13670 270 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 ARFRP1Q13795 201 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 BLMHQ13867 455 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 C1DQ13901 141 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 CBFBQ13951 182 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 DGCR6Q14129 220 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 SERTAD2Q14140 314 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 GNA13Q14344 377 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 GALEQ14376 348 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 GPR176Q14439 515 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 WFDC2Q14508 124 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 PPA1Q15181 289 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 RAB35Q15286 201 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 FCN2Q15485 313 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 SPHARQ15513 63 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 MED22Q15528 200 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 TAF13Q15543 124 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 OR8B8Q15620 311 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 KISS1Q15726 138 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 EFNB3Q15768 340 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 GRK1Q15835 563 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 NEDD8Q15843 81 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 ATP6AP1Q15904 470 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 ZNF726P1Q15940 193 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 SNCBQ16143 134 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 INAQ16352 499 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 BCL2A1Q16548 175 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 KCNMB1Q16558 191 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 BAK1Q16611 211 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 CTF1Q16619 201 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 PRSS8Q16651 343 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 MOGQ16653 247 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 GSTA3Q16772 222 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 TIGD6Q17RP2 521 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 NKPD1Q17RQ9 610 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 ZSWIM7Q19AV6 140 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 MICBQ29980 383 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 MICAQ29983 383 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 CLEC12BQ2HXU8 276 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 C5orf64Q2M2E5 130 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 C17orf58Q2M2W7 97 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 ZNF181Q2M3W8 571 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 TRIM16LQ309B1 348 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 DEFB135Q30KP9 77 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 CNPY1Q3B7I2 92 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 ANKRD55Q3KP44 614 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 ZNF718Q3SXZ3 478 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 SP6Q3SY56 376 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 ZNF260Q3ZCT1 412 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 Q3ZCU0 254 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 CCDC153Q494R4 210 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 ZNF404Q494X3 552 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 SLC36A2Q495M3 483 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 ZBED5Q49AG3 693 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 KCTD21Q4G0X4 260 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 FAM106AQ4KMX7 169 aa0.13□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 177.1 ms