RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc25a42Q8R0Y8 318 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 CmblQ8R1G2 245 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 MetrnlQ8VE43 311 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 2410137M14RikQ9CWF0 162 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mrpl13Q9D1P0 178 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr27Q9EQ90 311 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trav5-1A0A075B5Z7 114 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm28961A0A087WPA5 222 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm21858A0A087WQ24 222 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prss39O70169 367 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Wdr1O88342 606 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gng2P63213 71 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Adra2cQ01337 458 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q0VG62 139 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vax1Q2NKI2 338 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mef2aQ60929 498 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp874bQ7M6X2 447 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Smap2Q7TN29 428 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 H2-M10.4Q85ZW8 331 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 PcgF3Q8BTQ0 241 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ube3dQ8BX13 368 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 C1ql2Q8CFR0 287 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Neil1Q8K4Q6 389 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Alg12Q8VDB2 486 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr116Q923Q6 321 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 DohhQ99LN9 302 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cadm3Q99N28 396 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 2210010C04RikQ9CPN9 247 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 1700013G24RikQ9DAC6 286 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn1r91E9PZR7 307 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hdac3O88895 424 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 H2-K1P01901 369 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hoxb2P0C1T1 354 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 UbbP0CG49 305 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 PtgfrP43117 366 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hsd11b1P50172 292 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lin54Q571G4 749 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 PiglQ5SX19 252 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr517Q7TRU4 314 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr1240Q8VG73 314 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 GpnmbQ99P91 574 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q9DAE8 263 aa10.14□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Igkv12-89A0A0G2JGW8 112 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr623E9Q382 317 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr417F8VQB1 309 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gosr2O35166 212 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ntsr1O88319 424 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 AbraclQ4KML4 81 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Diras2Q5PR73 199 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Msrb2Q78J03 175 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc38a2Q8CFE6 504 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nedd4lQ8CFI0 1004 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc25a28Q8R0Z5 364 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Taf9Q8VI33 264 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 CenpmQ9CQA0 180 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Wdr31Q9JHB4 367 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cspg4Q8VHY0 2327 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 H2-DMaP28078 261 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 UngP97931 306 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Defb20Q30KP3 96 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sec14l3Q5SQ27 401 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 St8sia4Q64692 359 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ubqln3Q8C5U9 658 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Agpat2Q8K3K7 278 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn1r228Q8R2A7 333 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr354Q8VGJ8 317 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc33a1Q99J27 550 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Plscr5J3QM92 274 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm8857L7N291 182 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 GamtO35969 236 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cacng2O88602 323 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp58P16372 489 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Defb33Q30KN3 62 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr94Q6UAH0 386 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr93Q6UAH1 312 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp3Q8BLB0 497 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Alkbh6Q8K2U2 238 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn1r72Q8K3N7 306 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Znhit1Q8R331 154 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Polg2Q9QZM2 459 aa10.13□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kmt2bO08550 2713 aa10.12□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Muc5acE9QAQ8 3455 aa10.12□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 4930433I11RikA0A0U1RPT6 723 aa10.12□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm11127A7VMS2 374 aa10.12□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Smn1P97801 288 aa10.12□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm11110Q3U4K9 109 aa10.12□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr339Q8VGK8 309 aa10.12□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fyttd1Q91Z49 317 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Adarb1Q91ZS8 711 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Exosc4Q921I9 245 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr878Q9EQA9 314 aa10.12□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 P2ry14Q9ESG6 338 aa10.12□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gpx2Q9JHC0 190 aa10.12□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Alyref2Q9JJW6 218 aa10.12□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ankrd11E9Q4F7 2643 aa10.12□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm20715E9Q3L7 95 aa10.12□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ascl4M0QW46 144 aa10.12□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gfra3O35118 397 aa10.12□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cd59aO55186 123 aa10.12□□□□□ -0.79
Herc3-201ENSMUST00000031823 AF067061O70616 171 aa10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.5 ms