Protein–RNA interactions for Protein: Q64692

St8sia4, CMP-N-acetylneuraminate-poly-alpha-2,8-sialyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
St8sia4Q64692 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
St8sia4Q64692 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
St8sia4Q64692 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
St8sia4Q64692 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
St8sia4Q64692 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
St8sia4Q64692 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
St8sia4Q64692 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
St8sia4Q64692 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
St8sia4Q64692 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
St8sia4Q64692 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
St8sia4Q64692 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
St8sia4Q64692 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
St8sia4Q64692 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
St8sia4Q64692 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
St8sia4Q64692 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
St8sia4Q64692 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
St8sia4Q64692 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
St8sia4Q64692 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
St8sia4Q64692 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
St8sia4Q64692 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
St8sia4Q64692 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
St8sia4Q64692 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
St8sia4Q64692 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
St8sia4Q64692 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
St8sia4Q64692 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
St8sia4Q64692 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
St8sia4Q64692 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
St8sia4Q64692 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
St8sia4Q64692 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
St8sia4Q64692 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
St8sia4Q64692 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
St8sia4Q64692 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
St8sia4Q64692 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
St8sia4Q64692 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
St8sia4Q64692 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
St8sia4Q64692 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
St8sia4Q64692 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
St8sia4Q64692 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
St8sia4Q64692 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
St8sia4Q64692 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
St8sia4Q64692 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
St8sia4Q64692 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
St8sia4Q64692 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
St8sia4Q64692 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
St8sia4Q64692 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
St8sia4Q64692 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
St8sia4Q64692 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
St8sia4Q64692 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
St8sia4Q64692 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
St8sia4Q64692 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
St8sia4Q64692 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
St8sia4Q64692 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
St8sia4Q64692 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
St8sia4Q64692 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
St8sia4Q64692 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
St8sia4Q64692 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
St8sia4Q64692 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
St8sia4Q64692 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
St8sia4Q64692 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
St8sia4Q64692 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
St8sia4Q64692 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
St8sia4Q64692 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
St8sia4Q64692 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
St8sia4Q64692 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
St8sia4Q64692 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
St8sia4Q64692 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
St8sia4Q64692 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
St8sia4Q64692 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
St8sia4Q64692 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
St8sia4Q64692 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
St8sia4Q64692 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
St8sia4Q64692 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
St8sia4Q64692 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
St8sia4Q64692 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
St8sia4Q64692 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
St8sia4Q64692 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
St8sia4Q64692 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
St8sia4Q64692 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
St8sia4Q64692 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
St8sia4Q64692 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
St8sia4Q64692 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
St8sia4Q64692 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
St8sia4Q64692 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
St8sia4Q64692 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
St8sia4Q64692 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
St8sia4Q64692 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
St8sia4Q64692 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
St8sia4Q64692 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
St8sia4Q64692 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
St8sia4Q64692 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
St8sia4Q64692 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
St8sia4Q64692 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
St8sia4Q64692 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
St8sia4Q64692 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
St8sia4Q64692 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
St8sia4Q64692 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
St8sia4Q64692 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
St8sia4Q64692 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
St8sia4Q64692 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
St8sia4Q64692 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms