Protein–RNA interactions for Protein: P50172

Hsd11b1, Corticosteroid 11-beta-dehydrogenase isozyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsd11b1P50172 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Hsd11b1P50172 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Hsd11b1P50172 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Hsd11b1P50172 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hsd11b1P50172 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Hsd11b1P50172 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hsd11b1P50172 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hsd11b1P50172 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hsd11b1P50172 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hsd11b1P50172 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hsd11b1P50172 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hsd11b1P50172 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hsd11b1P50172 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hsd11b1P50172 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hsd11b1P50172 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hsd11b1P50172 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hsd11b1P50172 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hsd11b1P50172 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hsd11b1P50172 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Hsd11b1P50172 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hsd11b1P50172 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hsd11b1P50172 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Hsd11b1P50172 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hsd11b1P50172 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Hsd11b1P50172 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hsd11b1P50172 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hsd11b1P50172 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hsd11b1P50172 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Hsd11b1P50172 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hsd11b1P50172 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hsd11b1P50172 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Hsd11b1P50172 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hsd11b1P50172 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Hsd11b1P50172 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hsd11b1P50172 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Hsd11b1P50172 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hsd11b1P50172 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hsd11b1P50172 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hsd11b1P50172 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hsd11b1P50172 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hsd11b1P50172 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hsd11b1P50172 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hsd11b1P50172 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hsd11b1P50172 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hsd11b1P50172 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hsd11b1P50172 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hsd11b1P50172 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hsd11b1P50172 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hsd11b1P50172 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hsd11b1P50172 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hsd11b1P50172 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hsd11b1P50172 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Hsd11b1P50172 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hsd11b1P50172 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hsd11b1P50172 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hsd11b1P50172 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hsd11b1P50172 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hsd11b1P50172 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hsd11b1P50172 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hsd11b1P50172 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hsd11b1P50172 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hsd11b1P50172 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hsd11b1P50172 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hsd11b1P50172 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hsd11b1P50172 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Hsd11b1P50172 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hsd11b1P50172 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Hsd11b1P50172 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hsd11b1P50172 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hsd11b1P50172 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hsd11b1P50172 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hsd11b1P50172 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hsd11b1P50172 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hsd11b1P50172 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hsd11b1P50172 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hsd11b1P50172 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hsd11b1P50172 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hsd11b1P50172 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hsd11b1P50172 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hsd11b1P50172 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hsd11b1P50172 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hsd11b1P50172 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hsd11b1P50172 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hsd11b1P50172 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hsd11b1P50172 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hsd11b1P50172 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Hsd11b1P50172 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hsd11b1P50172 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hsd11b1P50172 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hsd11b1P50172 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hsd11b1P50172 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hsd11b1P50172 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hsd11b1P50172 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hsd11b1P50172 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hsd11b1P50172 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hsd11b1P50172 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hsd11b1P50172 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hsd11b1P50172 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hsd11b1P50172 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hsd11b1P50172 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms