RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000004430.13

Clcn3-201, Transcript of H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clcn3, Length 4,175 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Fam109bQ14B98 259 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Ewsr1Q61545 655 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr859Q7TRF5 309 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Pla2g3Q8BZT7 504 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gpx4Q91XR9 253 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Rab4bQ91ZR1 213 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr642Q924X8 314 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Dpep3Q9DA79 493 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Cabin1G3X8Q1 2187 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gm14403A2BFU4 402 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Zfp944E9PUS4 492 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Fam196aQ3USH1 422 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Arl11Q6P3A9 176 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Stoml3Q6PE84 287 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Rrnad1Q8BZG5 475 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 C1sbQ8CFG8 688 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr1279Q8VF38 313 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr638Q8VH20 321 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Tmprss2Q9JIQ8 490 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr66F8VQ01 311 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Prss12O08762 761 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Efnb2P52800 336 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Negr1Q80Z24 348 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Arf2Q8BSL7 181 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 1810024B03RikQ8BWE1 200 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Zfp286Q8C0E6 519 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Tmem234Q8R1E7 140 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr796Q8VGJ1 310 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Clec2dQ91V08 207 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Bbc3Q99ML1 193 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Rab27bQ99P58 218 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Bcl2l14Q9CPT0 328 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Rnaseh2cQ9CQ18 166 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Tmem88Q9D0N8 159 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Defb5Q9EPV9 64 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 OtofQ9ESF1 1997 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Heatr5bQ8C547 2070 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Fndc10A2A9Q0 223 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Zfp229E9PWT2 705 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 P01808 119 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Ca3P16015 260 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Pax4P32115 349 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Sft2d1Q5SSN7 159 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr506Q7TRU6 314 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Smim37Q8BT35 56 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Hbq1aQ8BYM1 145 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr1155Q8VFR3 314 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Abhd17aQ99JW1 310 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Mrpl24Q9CQ06 216 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Stard10Q9JMD3 291 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Neu3Q9JMH7 418 aa11.35□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Igkv1-135A0A0B4J1H7 120 aa11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr1490A0A1L1SVH0 321 aa11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr914E9PW59 316 aa11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Hprt1P00493 218 aa11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Rps16P14131 146 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Mcpt2P15119 244 aa11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Tmprss9P69525 1065 aa11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 SgcbP82349 320 aa11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Prss57Q14B24 284 aa11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Fbxo27Q6DIA9 280 aa11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Paqr7Q80ZE4 345 aa11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 4930451G09RikQ8C5G4 195 aa11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 BivmQ8CBX9 502 aa11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Lrrc20Q8CI70 184 aa11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Dusp18Q8VE01 188 aa11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Fam110cQ8VE94 421 aa11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Prb1Q91X93 504 aa11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 HypmQ9CR04 117 aa11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Zfand6Q9DCH6 223 aa11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 EdarQ9R187 448 aa11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Cdc34bA0A140T8I4 237 aa11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gm6890A2BG94 208 aa11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Spink14B9EJP9 96 aa11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Vmn2r76E9Q3F5 853 aa11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 P18524 117 aa11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gcnt2P97402 401 aa11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Pla2g7Q60963 440 aa11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr1281Q7TQY6 305 aa11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr1042Q7TR81 313 aa11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Fam169bQ8CHT6 337 aa11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr1394Q8VET2 312 aa11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 TsfmQ9CZR8 324 aa11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 B3GNT2Q9Z222 397 aa11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Dgat2l6A2ADU8 337 aa11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Mex3aG3UYU0 520 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Nkpd1Q0VF94 599 aa11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Inca1Q6PKN7 231 aa11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr107Q7TRK4 309 aa11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr205Q7TS37 305 aa11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Zfp459Q8BZ17 267 aa11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Anapc10Q8K2H6 185 aa11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Pom121Q8K3Z9 1200 aa11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr460Q8VF31 314 aa11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Ndufa9Q9DC69 377 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Tomm20Q9DCC8 145 aa11.34□□□□□ -0.59
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Vmn1r173E9Q8V7 313 aa11.33□□□□□ -0.6
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gpm6aP35802 278 aa11.33□□□□□ -0.6
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr5Q60889 312 aa11.33□□□□□ -0.6
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Plcxd1Q8CHS4 345 aa11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 40.8 ms