Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
P18524 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
P18524 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
P18524 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
P18524 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
P18524 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
P18524 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
P18524 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
P18524 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
P18524 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
P18524 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
P18524 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
P18524 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
P18524 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
P18524 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
P18524 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
P18524 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
P18524 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
P18524 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
P18524 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
P18524 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
P18524 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
P18524 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
P18524 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
P18524 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
P18524 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
P18524 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
P18524 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
P18524 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
P18524 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
P18524 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
P18524 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
P18524 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
P18524 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
P18524 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
P18524 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
P18524 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
P18524 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
P18524 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
P18524 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
P18524 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
P18524 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
P18524 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
P18524 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
P18524 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
P18524 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
P18524 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
P18524 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
P18524 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
P18524 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
P18524 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
P18524 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
P18524 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
P18524 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
P18524 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
P18524 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
P18524 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
P18524 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
P18524 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
P18524 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
P18524 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
P18524 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
P18524 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26■■□□□ 1.75
P18524 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
P18524 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
P18524 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
P18524 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
P18524 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
P18524 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
P18524 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
P18524 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
P18524 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
P18524 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
P18524 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
P18524 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
P18524 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
P18524 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
P18524 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
P18524 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
P18524 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
P18524 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
P18524 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
P18524 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
P18524 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
P18524 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
P18524 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
P18524 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
P18524 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
P18524 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
P18524 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
P18524 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
P18524 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
P18524 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
P18524 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
P18524 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
P18524 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
P18524 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
P18524 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
P18524 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
P18524 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
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