Protein–RNA interactions for Protein: P32115

Pax4, Paired box protein Pax-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax4P32115 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Pax4P32115 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Pax4P32115 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Pax4P32115 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Pax4P32115 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Pax4P32115 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Pax4P32115 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Pax4P32115 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Pax4P32115 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Pax4P32115 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pax4P32115 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pax4P32115 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pax4P32115 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Pax4P32115 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pax4P32115 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pax4P32115 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Pax4P32115 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pax4P32115 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pax4P32115 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Pax4P32115 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pax4P32115 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pax4P32115 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pax4P32115 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pax4P32115 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pax4P32115 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pax4P32115 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pax4P32115 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Pax4P32115 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Pax4P32115 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pax4P32115 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pax4P32115 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pax4P32115 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pax4P32115 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pax4P32115 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pax4P32115 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pax4P32115 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pax4P32115 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pax4P32115 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pax4P32115 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Pax4P32115 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pax4P32115 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pax4P32115 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pax4P32115 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pax4P32115 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pax4P32115 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pax4P32115 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pax4P32115 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pax4P32115 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pax4P32115 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pax4P32115 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pax4P32115 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pax4P32115 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Pax4P32115 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pax4P32115 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pax4P32115 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pax4P32115 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pax4P32115 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pax4P32115 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pax4P32115 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pax4P32115 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Pax4P32115 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pax4P32115 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pax4P32115 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pax4P32115 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pax4P32115 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pax4P32115 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pax4P32115 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pax4P32115 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pax4P32115 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pax4P32115 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pax4P32115 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pax4P32115 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pax4P32115 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pax4P32115 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Pax4P32115 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pax4P32115 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Pax4P32115 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Pax4P32115 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pax4P32115 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pax4P32115 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pax4P32115 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pax4P32115 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Pax4P32115 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pax4P32115 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pax4P32115 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pax4P32115 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pax4P32115 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pax4P32115 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pax4P32115 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pax4P32115 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pax4P32115 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pax4P32115 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pax4P32115 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pax4P32115 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pax4P32115 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pax4P32115 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pax4P32115 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Pax4P32115 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pax4P32115 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pax4P32115 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms