RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567377.5

COMMD4-218, Transcript of COMM domain containing 4, humanhuman

TSL 3

Gene COMMD4, Length 461 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD4-218ENST00000567377 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 FAM192AQ9GZU8 254 aa14.67□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 IFT22Q9H7X7 185 aa14.67□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 DPM3Q9P2X0 92 aa14.67□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 A0A087X0M5 115 aa14.66□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 A0A1B0GX30 115 aa14.66□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 F2RL2O00254 374 aa14.66□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 MYL12BO14950 172 aa14.66□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 HTR3BO95264 441 aa14.66□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 GNAO1P09471 354 aa14.66□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 FSTP19883 344 aa14.66□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 SLC34A1Q06495 639 aa14.66□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 DYNAPQ8N1N2 210 aa14.66□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 TFAP2CQ92754 450 aa14.66□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 COQ2Q96H96 371 aa14.66□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 MMP27Q9H306 513 aa14.66□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 ING4Q9UNL4 249 aa14.66□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 ERGIC3Q9Y282 383 aa14.66□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa14.65□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 A6NDX4 124 aa14.65□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 LEUTXA8MZ59 168 aa14.65□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 TOR1AO14656 332 aa14.65□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 LALBAP00709 142 aa14.65□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 BRS3P32247 399 aa14.65□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 EFNB2P52799 333 aa14.65□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 WNT4P56705 351 aa14.65□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 KRTAP10-3P60369 221 aa14.65□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 RNLSQ5VYX0 342 aa14.65□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 Q6ZTK2 550 aa14.65□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 OSR2Q8N2R0 312 aa14.65□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 OR4P4Q8NGL7 312 aa14.65□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 PGLYRP3Q96LB9 341 aa14.65□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 LINC00574Q9H8X3 128 aa14.65□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 FOXJ3Q9UPW0 622 aa14.65□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 ST3GAL6Q9Y274 331 aa14.65□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 HILPDAQ9Y5L2 63 aa14.65□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 TRAV24A0A0B4J272 114 aa14.64□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 FAM90A22PA8MWA6 464 aa14.64□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 OOSP1A8MZH6 123 aa14.64□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 XPNPEP2O43895 674 aa14.64□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 IGLV1-47P01700 117 aa14.64□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 HERPUD1Q15011 391 aa14.64□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 MPV17LQ2QL34 196 aa14.64□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa14.64□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa14.64□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa14.64□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 AHSA2Q719I0 299 aa14.64□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 C16orf82Q7Z2V1 217 aa14.64□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 Q8N2B8 174 aa14.64□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa14.64□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 OR10A7Q8NGE5 316 aa14.64□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 AKR1E2Q96JD6 320 aa14.64□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 PRSS22Q9GZN4 317 aa14.64□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 MEIKINA0A087WXM9 373 aa14.63□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa14.63□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 CHST1O43916 411 aa14.63□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 MMP23AO75900 390 aa14.63□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 CGB3P0DN86 165 aa14.63□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 CGB7P0DN87 165 aa14.63□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 GTF2F2P13984 249 aa14.63□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 GZMHP20718 246 aa14.63□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 PAX6P26367 422 aa14.63□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 OR3A4PP47883 348 aa14.63□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 RAB13P51153 203 aa14.63□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 RBM11P57052 281 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 C2orf68Q2NKX9 166 aa14.63□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 PLA1AQ53H76 456 aa14.63□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 LAIR2Q6ISS4 152 aa14.63□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa14.63□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 NANOGP1Q8N7R0 232 aa14.63□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 OR10K1Q8NGX5 313 aa14.63□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 MYDGFQ969H8 173 aa14.63□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 SPACA1Q9HBV2 294 aa14.63□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 FKBP14Q9NWM8 211 aa14.63□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 SCN3BQ9NY72 215 aa14.63□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 KIF25Q9UIL4 384 aa14.63□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 MEGF11A6BM72 1044 aa14.62□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 CDRT1O95170 752 aa14.62□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 CELP19835 753 aa14.62□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 DOC2BQ14184 412 aa14.62□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 C17orf58Q2M2W7 97 aa14.62□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 PIGYQ3MUY2 71 aa14.62□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 MS4A15Q8N5U1 240 aa14.62□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 OR9G1Q8NH87 305 aa14.62□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 MND1Q9BWT6 205 aa14.62□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 CALYQ9NYX4 217 aa14.62□□□□□ -0.07
COMMD4-218ENST00000567377 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms