RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 A0A087X0M5 115 aa12.63□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 A0A1B0GX30 115 aa12.63□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 DEGS1O15121 323 aa12.63□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 IGHG2P01859 326 aa12.63□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 OCM2P0CE71 109 aa12.63□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 MNAT1P51948 309 aa12.63□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 NXNL2Q5VZ03 156 aa12.63□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 ZFAND6Q6FIF0 208 aa12.63□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 TEX38Q6PEX7 206 aa12.63□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 MOB3BQ86TA1 216 aa12.63□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 SPATA24Q86W54 205 aa12.63□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 SBSPONQ8IVN8 264 aa12.63□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 ARHGAP24Q8N264 748 aa12.63□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 HRASLS5Q96KN8 279 aa12.63□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 RCHY1Q96PM5 261 aa12.63□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 CALYQ9NYX4 217 aa12.63□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 FGF16O43320 207 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 FKBP6O75344 327 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 ZNF20P17024 532 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 SLC6A1P30531 599 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 GNGT1P63211 74 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 COMMD1Q8N668 190 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 DNAAF1Q8NEP3 725 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 OR8U1Q8NH10 309 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 OPALINQ96PE5 141 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 THTPAQ9BU02 230 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 COMMD4Q9H0A8 199 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 KIF25Q9UIL4 384 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 GNG8Q9UK08 70 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 CSMD3Q7Z407 3707 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 MEIKINA0A087WXM9 373 aa12.61□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 KDM4BO94953 1096 aa12.61□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 PRKACBP22694 351 aa12.61□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 GPR12P47775 334 aa12.61□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 EFNB1P98172 346 aa12.61□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 MADCAM1Q13477 382 aa12.61□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 GPR50Q13585 617 aa12.61□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa12.61□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 Q8NFD4 153 aa12.61□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 OR13C9Q8NGT0 318 aa12.61□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 OR10AC1Q8NH08 325 aa12.61□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 UBALD1Q8TB05 177 aa12.61□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 MRGPRDQ8TDS7 321 aa12.61□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 PP6455Q8WZ26 134 aa12.61□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 AQP12BA6NM10 295 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 CGB3P0DN86 165 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 CGB7P0DN87 165 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 T-ENOLP0DO92 83 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 LYL1P12980 280 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 CHATP28329 748 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 GP2P55259 537 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 KIR2DS1Q14954 304 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 CDK5R1Q15078 307 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 C12orf73Q69YU5 71 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 FAHD1Q6P587 224 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 AQP12AQ8IXF9 295 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 OR51A4Q8NGJ6 313 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 OR10X1Q8NGY0 326 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 OR5B12Q96R08 314 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 PALMDQ9NP74 551 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 OR6C3Q9NZP0 311 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 H0YJX3 145 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 AP4M1O00189 453 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 OR2T7P0C7T2 308 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 SSTR5P35346 364 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 ATP6V1E1P36543 226 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 ZNF85Q03923 595 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 GID4Q8IVV7 300 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 CCDC54Q8NEL0 328 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 OR11H1Q8NG94 326 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 HSPB9Q9BQS6 159 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 OSBPL10Q9BXB5 764 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 PRRG3Q9BZD7 231 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 KRT84Q9NSB2 600 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 HYDINQ4G0P3 5121 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-227ENST00000551441 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 ZAR1LA6NP61 321 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 HSD17B6O14756 317 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 SULT1C4O75897 302 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 FAM107AO95990 144 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 IL1AP01583 271 aa12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms