RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519813.1

TMPRSS4-208, Transcript of transmembrane serine protease 4, human

TSL 5

Gene TMPRSS4, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMPRSS4-208	ENST00000519813	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		6.25	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	CEP290	O15078	2479 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	IFNL4	K9M1U5	179 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	AQP7	O14520	342 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	TSPAN15	O95858	294 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	HBE1	P02100	147 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	OR8U8	P0C7N1	319 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	PATE4	P0C8F1	98 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	SDHB	P21912	280 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	AADAC	P22760	399 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	F2R	P25116	425 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	GPM6A	P51674	278 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	VAMP2	P63027	116 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	ARG2	P78540	354 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	PAX5	Q02548	391 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	SRY	Q05066	204 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	SPEM2	Q0P670	501 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	PMS2P11	Q13670	270 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	IGFBP7	Q16270	282 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	MIDN	Q504T8	468 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	ZNF766	Q5HY98	468 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	CALHM1	Q8IU99	346 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	WNT2B	Q93097	391 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	TOMM40L	Q969M1	308 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	SARAF	Q96BY9	339 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	RAB9B	Q9NP90	201 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	TREM1	Q9NP99	234 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	COA4	Q9NYJ1	87 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	MSGN1	A6NI15	193 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	WRB	O00258	174 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	MSTN	O14793	375 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	PITX3	O75364	302 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	MED6	O75586	246 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	TSPAN9	O75954	239 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	HLA-H	P01893	362 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	SERPINE2	P07093	398 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	BCL3	P20749	454 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	CCNO	P22674	350 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	HOXC12	P31275	282 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	SNCA	P37840	140 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	FXYD4	P59646	89 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	ERVK11-1	P61568	191 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	SERF2	P84101	59 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	TLE4	Q04727	773 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	P2RY6	Q15077	328 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	MST1L	Q2TV78	715 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813		Q6ZT83	130 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	WDR31	Q8NA23	367 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	PRR7	Q8TB68	274 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	NEK7	Q8TDX7	302 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	SLC39A7	Q92504	469 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	HRH4	Q9H3N8	390 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	CDH20	Q9HBT6	801 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	FBXL17	Q9UF56	701 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		6.22	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		6.22	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		6.22	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	IL18BP	O95998	194 aa		6.22	□□□□□ -1.41
TMPRSS4-208	ENST00000519813	FOLR2	P14207	255 aa		6.22	□□□□□ -1.41

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