RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485621.1

TRAPPC10-211, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC10, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-211ENST00000485621 EFNA4P52798 201 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 CDK5Q00535 292 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 GLO1Q04760 184 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 TRIP10Q15642 601 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 SGCAQ16586 387 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 SLC36A2Q495M3 483 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 SLC36A3Q495N2 470 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 ARMCX4Q5H9R4 360 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 SPATA46Q5T0L3 261 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 ACSM5Q6NUN0 579 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 FAHD1Q6P587 224 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 LEG1Q6P5S2 330 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 HDDC2Q7Z4H3 204 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 NAA40Q86UY6 237 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 BBS1Q8NFJ9 593 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR4F15Q8NGB8 312 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR52E2Q8NGJ4 325 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR51L1Q8NGJ5 315 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 LINC01006Q8NI28 216 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 SLC25A40Q8TBP6 338 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 ST7LQ8TDW4 575 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 GIPC3Q8TF64 312 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 PTP4A1Q93096 173 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 MCUR1Q96AQ8 359 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 PAXXQ9BUH6 204 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 REG4Q9BYZ8 158 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR2J1Q9GZK6 312 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 TPK1Q9H3S4 243 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 REEP1Q9H902 201 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 WDR76Q9H967 626 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 DCAF16Q9NXF7 216 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 KLHL21Q9UJP4 597 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 FKBP7Q9Y680 259 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZFHX3Q15911 3703 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 C5orf49A4QMS7 147 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 CCDC182A6NF36 153 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 FAM25EA8MYX2 175 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 H0YL77 283 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 XKRYO14609 159 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 SGCEO43556 437 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 GMNNO75496 209 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 FARS2O95363 451 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 STAMBPO95630 424 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 IGHV1-46P01743 117 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 ADRA2AP08913 450 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 ACSM4P0C7M7 580 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR9G9P0C7N8 305 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 COX5BP10606 129 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 SPI1P17947 270 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 COL8A2P25067 703 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 IFNA8P32881 189 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 DAPP51397 102 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 UCP2P55851 309 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 SMIM11AP58511 58 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 PPP1CBP62140 327 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 LSM6P62312 80 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 HSF2Q03933 536 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 PSG7Q13046 419 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 AQP6Q13520 282 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 RIPK1Q13546 671 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 RAB35Q15286 201 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 ATP6AP1Q15904 470 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 TBC1D28Q2M2D7 210 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 TMEM236Q5W0B7 351 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 CST9LP1Q5W188 147 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 MZT2BQ6NZ67 158 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 TMEM53Q6P2H8 277 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 BTNL8Q6UX41 500 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 DPPA2Q7Z7J5 298 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 BIVMQ86UB2 503 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 SPATA24Q86W54 205 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 TIGD4Q8IY51 512 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 BEST4Q8NFU0 473 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 FNDC8Q8TC99 324 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 RBP7Q96R05 134 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 TSSK6Q9BXA6 273 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 BPESC1Q9GZL8 116 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 RERGLQ9H628 205 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 SLC25A19Q9HC21 320 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 CMC2Q9NRP2 79 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 FAIMQ9NVQ4 179 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF319Q9P2F9 582 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 DNAJB9Q9UBS3 223 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 TMCC3Q9ULS5 477 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 STARD10Q9Y365 291 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 CACNG2Q9Y698 323 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 NF1P21359 2839 aa3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 A0A1B0GWJ7 208 aa3.42□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 LRP5LA4QPB2 252 aa3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms